RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF150Q9ULK6 438 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ABCG2Q9UNQ0 655 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 B9D1Q9UPM9 204 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ICKQ9UPZ9 632 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PLLPQ9Y342 182 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 V9GYQ6 96 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa3.31□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 INSRP06213 1382 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ELP1O95163 1332 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A0G2JLW4 131 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM8BA6NDV4 472 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM150CB9EJG8 249 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 E7EWF7 191 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 F5H697 171 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 H7C1Q1 480 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PDLIM1O00151 329 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PPM1DO15297 605 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC16A5O15375 505 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNN4O15554 427 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ADAM12O43184 909 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SCO2O43819 266 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LPXNO60711 386 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PRAF2O60831 178 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LRP3O75074 770 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP2C2O75185 946 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2F2O95006 317 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C1RP00736 705 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IFNA14P01570 189 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MT-ND2P03891 347 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CSN3P07498 182 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CHRNGP07510 517 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SERPINA6P08185 405 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FCER1AP12319 257 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ETFAP13804 333 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GP9P14770 177 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IDO1P14902 403 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 EPCAMP16422 314 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF23P17027 643 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB4AP20338 218 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 UQCRC2P22695 453 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NMBRP28336 390 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 STX2P32856 288 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HMGCLP35914 325 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TUFMP49411 452 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CLCN5P51795 746 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 EMP2P54851 167 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CDK16Q00536 496 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FUT7Q11130 342 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GRIK3Q13003 919 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MELKQ14680 651 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM132DQ14C87 1099 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LY6KQ17RY6 165 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM214AQ32MH5 1076 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TIGD2Q4W5G0 525 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 EFCAB12Q6NXP0 572 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC39A4Q6P5W5 647 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 QSOX2Q6ZRP7 698 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DPPA4Q7L190 304 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ARCQ7LC44 396 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC25Q86WR0 208 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIM69Q86WT6 500 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KLBQ86Z14 1044 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TBC1D10CQ8IV04 446 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GALNT16Q8N428 558 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NECAP1Q8NC96 275 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 BEST2Q8NFU1 509 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR7G2Q8NG99 324 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR4A15Q8NGL6 344 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 UBTD2Q8WUN7 234 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PIGCQ92535 297 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GTF2H4Q92759 462 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HIST1H2ACQ93077 130 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SERAC1Q96JX3 654 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C3orf30Q96M34 536 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 VSTM2LQ96N03 204 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GPR137Q96N19 417 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF570Q96NI8 536 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OSBPL9Q96SU4 736 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CTRCQ99895 268 aa3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms