RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 VNN3Q9NY84 501 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 CACNA1HO95180 2353 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GTW7 788 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 DLGAP1O14490 977 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 CAPNS1P04632 268 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ATP6V1B1P15313 513 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 MATN1P21941 496 aa7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 HSPA13P48723 471 aa7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 MERTKQ12866 999 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SAXO2Q658L1 398 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 OR4K14Q8NGD5 310 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 LZICQ8WZA0 190 aa7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 DOHHQ9BU89 302 aa7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 NINQ8N4C6 2090 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 THADAQ6YHU6 1953 aa7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 J3KTA2 159 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 CEP68Q76N32 757 aa7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 ADAP2Q9NPF8 381 aa7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 ALBP02768 609 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ARAFP10398 606 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 CYP4B1P13584 511 aa7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 ARHGDIAP52565 204 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 GPAT3Q53EU6 434 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 RNF44Q7L0R7 432 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SPRED1Q7Z699 444 aa7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 NUP43Q8NFH3 380 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.93□□□□□ -1.14
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CS-215ENST00000549143 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ELP4Q96EB1 424 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 PEX11GQ96HA9 241 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 PHF11Q9UIL8 331 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SLC22A7Q9Y694 548 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 SPACA6W5XKT8 324 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-215ENST00000549143 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
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