RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534382.5

CTSB-231, Transcript of cathepsin B, human

TSL 4

Gene CTSB, Length 764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSB-231	ENST00000534382	SERPINB5	P36952	375 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ALDH9A1	P49189	494 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	SSR4	P51571	173 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	HK2	P52789	917 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ERVK-8	P63133	956 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	NR6A1	Q15406	480 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	DOK4	Q8TEW6	326 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ZBTB9	Q96C00	473 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	C5orf34	Q96MH7	638 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	TAAR6	Q96RI8	345 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	HES7	Q9BYE0	225 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	KLHL1	Q9NR64	748 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25	1e-18	■■□□□ 12
CTSB-231	ENST00000534382	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	WWP2	O00308	870 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	SLC28A1	O00337	649 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	TM9SF1	O15321	606 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	SLC25A12	O75746	678 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	OR2J2	O76002	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	CHEK2	O96017	543 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	IL3	P08700	152 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	GSTM5	P46439	218 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	KANK2	Q63ZY3	851 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	NUBPL	Q8TB37	319 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	KLHL29	Q96CT2	875 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	RASL10B	Q96S79	203 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	EBPL	Q9BY08	206 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	OLAH	Q9NV23	265 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	HEY2	Q9UBP5	337 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	OR6C76	A6NM76	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	RGS14	O43566	566 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	NME2P1	O60361	137 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	NT5E	P21589	574 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	NME2	P22392	152 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	PRPH2	P23942	346 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	SERPINB4	P48594	390 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	SLC37A1	P57057	533 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	MPEG1	Q2M385	716 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	PIGG	Q5H8A4	983 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ASB15	Q8WXK1	588 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	NR4A3	Q92570	626 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CTSB-231	ENST00000534382	ESPL1	Q14674	2120 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382		A8MVJ9	347 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	BIRC5	O15392	142 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SEC22B	O75396	215 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	OR6B1	O95007	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	ZWINT	O95229	277 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	ATP1B1	P05026	303 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	CT62	P0C5K7	136 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	LINC00032	P0C843	101 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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