RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 NDC1Q9BTX1 674 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 CHST8Q9H2A9 424 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRA2Q9H9E1 313 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 PRDM9Q9NQV7 894 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 NDOR1Q9UHB4 597 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 EVPLLA8MZ36 301 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 TGFBR3LH3BV60 316 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT36O76013 467 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP6V1G2O95670 118 aa20.62■□□□□ 0.89
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PACSIN3-209ENST00000532457 C1orf189Q5VU69 101 aa20.62■□□□□ 0.89
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PACSIN3-209ENST00000532457 OR2T12Q8NG77 320 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 OR9A2Q8NGT5 310 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 DOK4Q8TEW6 326 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 ENTPD4Q9Y227 616 aa20.62■□□□□ 0.89
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PACSIN3-209ENST00000532457 CLDN16Q9Y5I7 305 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 SPACA6W5XKT8 324 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 FER1L5A0AVI2 2057 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 ARPC2O15144 300 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 GPR75O95800 540 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 MPIP34949 423 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF130Q86XS8 419 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 PTOV1Q86YD1 416 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 SPPL2CQ8IUH8 684 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 BMPERQ8N8U9 685 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 TANKQ92844 425 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 FANCEQ9HB96 536 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 DSCR3O14972 297 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 CCL4P13236 92 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 CPMP14384 443 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 CCT3P49368 545 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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PACSIN3-209ENST00000532457 SAXO2Q658L1 398 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 NIPAL1Q6NVV3 410 aa20.6■□□□□ 0.89
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PACSIN3-209ENST00000532457 SIMC1Q8NDZ2 872 aa20.6■□□□□ 0.89
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PACSIN3-209ENST00000532457 COL26A1Q96A83 441 aa20.6■□□□□ 0.89
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PACSIN3-209ENST00000532457 ETFAP13804 333 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 BNIP2Q12982 314 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM107Q6UX40 140 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 C6orf120Q7Z4R8 191 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 SERPINA11Q86U17 422 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 MAGED4Q96JG8 741 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 CTRCQ99895 268 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 NEUROD4Q9HD90 331 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC22A11Q9NSA0 550 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 KNTC1P50748 2209 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC187A0A096LP49 1063 aa20.59■□□□□ 0.89
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PACSIN3-209ENST00000532457 PSMG1O95456 288 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 PORP16435 677 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 XCR1P46094 333 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 ARSFP54793 590 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 RPS26P62854 115 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 SKP1P63208 163 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 GLYATQ6IB77 296 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 ZZZ3Q8IYH5 903 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 MICU2Q8IYU8 434 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 OR52N2Q8NGI0 321 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 ELP4Q96EB1 424 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 NEURL3Q96EH8 262 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 MVB12AQ96EY5 273 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 RARRES3Q9UL19 164 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 AP3M1Q9Y2T2 418 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-209ENST00000532457 ELOVL7A1L3X0 281 aa20.58■□□□□ 0.89
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