RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 FETUBQ9UGM5 382 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 OARD1Q9Y530 152 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 DSCAMO60469 2012 aa14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 RNF212BA8MTL3 300 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 A8MXE2 369 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 SIAH2O43255 324 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 TTC4O95801 387 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ACTL6AO96019 429 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 CYP4B1P13584 511 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 SLCO1A2P46721 670 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 PCYT1AP49585 367 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF75DP51815 510 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 PLIN5Q00G26 463 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 RPS6KA2Q15349 733 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 PACS2Q86VP3 889 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 TAGAPQ8N103 731 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 BBOF1Q8ND07 529 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-206ENST00000530405 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 OR6C76A6NM76 312 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 CAPN14A8MX76 684 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 SCELO95171 688 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 CPN1P15169 458 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 CPN2P22792 545 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 SOX18P35713 384 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 MC3RP41968 323 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 MASP1P48740 699 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 NAGLUP54802 743 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 DIO3P55073 304 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC37A1P57057 533 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 EIPR1Q53HC9 387 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 BICRALQ6AI39 1079 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 TTC27Q6P3X3 843 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 UCN2Q96RP3 112 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 CLGNO14967 610 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 PRAMEF4O60810 478 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 HERVK_113P63132 956 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 ERVK-8P63133 956 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 GAB1Q13480 694 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 TOMM20Q15388 145 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 MED12LQ86YW9 2145 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 PHC2Q8IXK0 858 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 TANKQ92844 425 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 WNT2BQ93097 391 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 TP53INP1Q96A56 240 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 WDR34Q96EX3 536 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 CERS2Q96G23 380 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 NAT9Q9BTE0 207 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-206ENST00000530405 MED12Q93074 2177 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms