RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 OR5P2Q8WZ92 322 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC115Q96NT0 180 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 GLIPR2Q9H4G4 154 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 RMND5AQ9H871 391 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 NEUROD4Q9HD90 331 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 NDUFAF1Q9Y375 327 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC88CQ9P219 2028 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PRB8 838 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PS29 197 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SLITRK5O94991 958 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 MMP11P24347 488 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 DUSP2Q05923 314 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 STX5Q13190 355 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SSPNQ14714 243 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 TGIF1Q15583 401 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 MAPKAPK3Q16644 382 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF750Q32MQ0 723 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM151BQ8IW70 566 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC116Q8IYX3 515 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SERHLQ9NQF3 203 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ASPDHA6ND91 283 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 COX4I1P13073 169 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 MANFP55145 182 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CLN3Q13286 438 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SNX32Q86XE0 403 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 DPP10Q8N608 796 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF675Q8TD23 568 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 GTF2H4Q92759 462 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 GATA6Q92908 595 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 DGAT2Q96PD7 388 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 LOC100653049A0A140TA62 436 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ANGPT2O15123 496 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT34O76011 436 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD37Q7Z713 158 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAJB8Q8NHS0 232 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CTHRC1Q96CG8 243 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ITCHQ96J02 903 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 TAS2R9Q9NYW1 312 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-205ENST00000528462 OR10H2O60403 315 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 TRPC1P48995 793 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 RPS18P62269 152 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 HBA1P69905 142 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 MAP4K2Q12851 820 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM69BQ5VUD6 431 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 LANCL3Q6ZV70 420 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 DPH1Q9BZG8 443 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 IL17BQ9UHF5 180 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDHGB4Q9UN71 923 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa20.58■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 PLOD2O00469 737 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 FBP2O00757 339 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 C6orf47O95873 294 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 CAPNS1P04632 268 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 RETREG3Q86VR2 466 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD46Q86W74 232 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 CLECL1Q8IZS7 167 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 RIT1Q92963 219 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 NTMQ9P121 344 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 TAGLN3Q9UI15 199 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 PLOD3O60568 738 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 CREG1O75629 220 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 NPPAP01160 153 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 IFNA16P05015 189 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 ZCCHC18P0CG32 403 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 LIFP15018 202 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPN6P29350 595 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 SOX18P35713 384 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 MGAT2Q10469 447 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF628Q5EBL2 1059 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 PAGE3Q5JUK9 113 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 LRIF1Q5T3J3 769 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC2A7Q6PXP3 512 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-205ENST00000528462 GALNT12Q8IXK2 581 aa20.56■□□□□ 0.88
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