RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.48□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 OR2L2Q8NH16 312 aa7.48□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 UBTD2Q8WUN7 234 aa7.48□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 LCN9Q8WX39 176 aa7.48□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 SMPDL3AQ92484 453 aa7.48□□□□□ -1.21
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TRPS1-208ENST00000519076 COL26A1Q96A83 441 aa7.48□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ADI1Q9BV57 179 aa7.48□□□□□ -1.21
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TRPS1-208ENST00000519076 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.47□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 PTGES3LE9PB15 166 aa7.47□□□□□ -1.21
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TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.47□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 GNALP38405 381 aa7.47□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 CDKN2CP42773 168 aa7.47□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 IL5RAQ01344 420 aa7.47□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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