RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 GNB3P16520 340 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPN6P29350 595 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 OPRL1P41146 370 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM72BQ86X60 149 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 FADS6Q8N9I5 356 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 KRT12Q99456 494 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 GPA33Q99795 319 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR81Q562E7 1941 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 H0YCG3 227 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 E2F3O00716 465 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 BUB1O43683 1085 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 FHP07954 510 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PRG2P13727 222 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TNNI3P19429 210 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP2R1AP30153 589 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MATKP42679 507 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 NDST1P52848 882 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 RBBP4Q09028 425 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 GCKRQ14397 625 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 USH1GQ495M9 461 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 DDI2Q5TDH0 399 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 OR2T34Q8NGX1 318 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB33BQ9H082 229 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF222A6NCQ9 220 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MAPK13O15264 365 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TNFSF12O43508 249 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TSPAN2O60636 221 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 NDUFA7O95182 113 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CLDN1O95832 211 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 NAAAQ02083 359 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 NFATC2Q13469 925 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 KDELC1Q6UW63 502 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 Q6ZRP5 223 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNK13Q9HB14 408 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 E9PMD0 336 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SGK494L7N484 410 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 OR4F21O95013 312 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PRAMEF12O95522 483 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR89BP0CG08 455 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SELEP16581 610 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 DPP4P27487 766 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMA5P28066 241 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 ID1P41134 155 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 PTGFRP43088 359 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 GNB1P62873 340 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 DHODHQ02127 395 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC17A1Q14916 467 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM189A2Q15884 450 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 HKDC1Q2TB90 917 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms