RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511237.5

SH3BP2-219, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 517 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-219ENST00000511237 LAPTM5Q13571 262 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 DOC2AQ14183 400 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 NTRK2Q16620 822 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 DOK4Q8TEW6 326 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TANKQ92844 425 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 RILPQ96NA2 401 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 GALNT8Q9NY28 637 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 OR10H2O60403 315 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 SH3BGRLO75368 114 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 BANF1O75531 89 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 FPR1P21462 350 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 SSR2P43308 183 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 DIO3P55073 304 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 HERVK_113P63132 956 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ERVK-8P63133 956 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 SLAMF1Q13291 335 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 SPC24Q8NBT2 197 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 BBOF1Q8ND07 529 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 RIT1Q92963 219 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 VPS39Q96JC1 886 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TM9SF2Q99805 663 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 WWOXQ9NZC7 414 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 FREM3P0C091 2139 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 NCKAP5O14513 1909 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TRIM64BA6NI03 449 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 OR6C76A6NM76 312 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TGFB1P01137 390 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 FBXW4P57775 412 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 IRF8Q02556 426 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 PCDH1Q08174 1060 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 FOXF2Q12947 444 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 CBLBQ13191 982 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ZNF460Q14592 562 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 RPS6KA2Q15349 733 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 PPP1R7Q15435 360 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TGFBIQ15582 683 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 EIPR1Q53HC9 387 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 BICRALQ6AI39 1079 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TMEM64Q6YI46 380 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TRIM58Q8NG06 486 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 PERPQ96FX8 193 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 CFAP36Q96G28 342 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 CCL19Q99731 98 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 UBQLN3Q9H347 655 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 PIGMQ9H3S5 423 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 STK16O75716 305 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 ACTL6AO96019 429 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 PCNAP12004 261 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 HSPA7P48741 367 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 SLC12A2P55011 1212 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 NRG3P56975 720 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP2-219ENST00000511237 SRYQ05066 204 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms