RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 GRID1Q9ULK0 1009 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 NINQ8N4C6 2090 aa17.33■□□□□ 0.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PINLYPA6NC86 204 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYABP02511 175 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 HSD3B1P14060 373 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CPA3P15088 417 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 HSD3B2P26439 372 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SSTR4P31391 388 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 MEOX1P50221 254 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJB13P59910 316 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 IFFO1Q0D2I5 559 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 LIPMQ5VYY2 423 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SIAH3Q8IW03 269 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SSC4DQ8WTU2 575 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CHTF18Q8WVB6 975 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ASB15Q8WXK1 588 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 TM4SF18Q96CE8 201 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC126Q96EE4 140 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM111AQ96PZ2 611 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 GAL3ST4Q96RP7 486 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 HEY2Q9UBP5 337 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS29Q9UBQ0 182 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 STK38LQ9Y2H1 464 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 G3V3Y1 287 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDH7O60245 1069 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ULK1O75385 1050 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 NADKO95544 446 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 LDLRP01130 860 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3R1P27986 724 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINB3P29508 390 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 HSF1Q00613 529 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ASPHQ12797 758 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 C1QL3Q5VWW1 255 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC6AQ6EIG7 209 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC48A1Q6P1K1 146 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 IL20RBQ6UXL0 311 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 GFRALQ6UXV0 394 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SULF2Q8IWU5 870 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CNPY4Q8N129 248 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 MREGQ8N565 214 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 HORMAD2Q8N7B1 307 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 OR8K3Q8NH51 312 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 RIT1Q92963 219 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC14L3Q9UDX4 400 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CES1P1Q9UKY3 287 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PLLPQ9Y342 182 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC13O75165 2243 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 A1L4Q6 167 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 A8MVJ9 347 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 IL3P08700 152 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35E2P0CK97 266 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CPMP14384 443 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDH9A1P49189 494 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC37A1P57057 533 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 BTKQ06187 659 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF844Q08AG5 666 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 EBPQ15125 230 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 LYPD8Q6UX82 237 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF111Q6ZNA4 994 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PSD4Q8NDX1 1056 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SIMC1Q8NDZ2 872 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJB8Q8NHS0 232 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM125Q96AQ2 219 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL29Q96CT2 875 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 WWTR1Q9GZV5 400 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CXorf21Q9HAI6 301 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 HPF1Q9NWY4 346 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 MCM8Q9UJA3 840 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB21Q9UL25 225 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVK-11Q9UQG0 969 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC5A6Q9Y289 635 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 DTX4Q9Y2E6 619 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf226A1L170 272 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 NPIPA5E9PKD4 350 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRNGP07510 517 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF24P17028 368 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDH3A1P30838 453 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SOX18P35713 384 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 FEN1P39748 380 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 DUSP8Q13202 625 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 LTB4RQ15722 352 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP157Q5JU67 520 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNT12Q8IXK2 581 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4K14Q8NGD5 310 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 NUBPLQ8TB37 319 aa17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms