RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-215	ENST00000494945	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	MS4A2	Q01362	244 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	DUSP2	Q05923	314 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	CCNI	Q14094	377 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	MAP7	Q14244	749 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	CYP51A1	Q16850	503 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	SAXO2	Q658L1	398 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	CPZ	Q66K79	652 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	LCN8	Q6JVE9	175 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	DHFR2	Q86XF0	187 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	PROSER1	Q86XN7	944 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	MICU2	Q8IYU8	434 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	COL26A1	Q96A83	441 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ELP4	Q96EB1	424 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	CMKLR1	Q99788	373 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	CHST8	Q9H2A9	424 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	PLOD2	O00469	737 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ARPC2	O15144	300 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	EMC8	O43402	210 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	B4GALT2	O60909	372 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	LDB3	O75112	727 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	FKBP6	O75344	327 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	GMNN	O75496	209 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	KCNK5	O95279	499 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ONECUT2	O95948	504 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	NTRK1	P04629	796 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	SLC35E2	P0CK97	266 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	BMP2	P12643	396 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	MVD	P53602	400 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	MAPK10	P53779	464 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	STX4	Q12846	297 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	SLC13A2	Q13183	592 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	RGN	Q15493	299 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	SYT16	Q17RD7	645 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	MTX3	Q5HYI7	312 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF675	Q8TD23	568 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	STMN2	Q93045	179 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	LRGUK	Q96M69	825 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	LANCL2	Q9NS86	450 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	NTM	Q9P121	344 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	KNTC1	P50748	2209 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945		A0A1W2PS29	197 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	AQP12B	A6NM10	295 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	GSTA4	O15217	222 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	TNFRSF21	O75509	655 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	TIAF1	O95411	115 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	C1QC	P02747	245 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	C8B	P07358	591 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	GGT1	P19440	569 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	GALNS	P34059	522 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PKP4-215	ENST00000494945	CRAT	P43155	626 aa		10.34	□□□□□ -0.75

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