RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 GSTM5P46439 218 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SRP54P61011 504 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 RAB33AQ14088 237 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 AANATQ16613 207 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LUZP2Q86TE4 346 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SLC39A11Q8N1S5 342 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CLDN22Q8N7P3 220 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CHST14Q8NCH0 376 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB44Q8NCP5 570 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 DUSP18Q8NEJ0 188 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LHFPL5Q8TAF8 219 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CMTM7Q96FZ5 175 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 DEFB118Q96PH6 123 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PKP4Q99569 1192 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MARVELD1Q9BSK0 173 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TSSK6Q9BXA6 273 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ATG10Q9H0Y0 220 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SLC43A1O75387 559 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CXCL10P02778 98 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ITGB7P26010 798 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SERPINA4P29622 427 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 KLHL22Q53GT1 634 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 FAM181AQ8N9Y4 354 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 C7orf57Q8NEG2 295 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 POF1BQ8WVV4 589 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MARVELD3Q96A59 401 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SIPA1Q96FS4 1042 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 RAF1P04049 648 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 AMD1P17707 334 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PXNP49023 591 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CHMP1BQ7LBR1 199 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 KRT74Q7RTS7 529 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 NFKBIDQ8NI38 313 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CEP76Q8TAP6 659 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 UBTD2Q8WUN7 234 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SCAMP4Q969E2 229 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 P2RY13Q9BPV8 354 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 KCNN2Q9H2S1 579 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TVP23BQ9NYZ1 205 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SCML1Q9UN30 329 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SLC22A14Q9Y267 594 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MYO7AQ13402 2215 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 A0A0A6YYJ9 748 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SOCS5O75159 536 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 URODP06132 367 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 C1SP09871 688 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 NSG1P42857 185 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 WNT3P56703 355 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TEKQ02763 1124 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZNF91Q05481 1191 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 GRK1Q15835 563 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 COX20Q5RI15 118 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CPTPQ5TA50 214 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 OR2G6Q5TZ20 316 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 BICRALQ6AI39 1079 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PRSS42Q7Z5A4 293 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 OR4C15Q8NGM1 316 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 GATAD2BQ8WXI9 593 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SLC32A1Q9H598 525 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ACER3Q9NUN7 267 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ENOPH1Q9UHY7 261 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZAR1LA6NP61 321 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 AGAP14A8MT82 685 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SLC30A4O14863 429 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 KPNA5O15131 536 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TOXO94900 526 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 IFNA7P01567 189 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 RPS25P62851 125 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PPP3R1P63098 170 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ACSM2AQ08AH3 577 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TEAD4Q15561 434 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ACSM2BQ68CK6 577 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 BHLHB9Q6PI77 547 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZVU0 165 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TCEAL8Q8IYN2 117 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 NANOGP1Q8N7R0 232 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PROKR2Q8NFJ6 384 aa12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms