RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485604.1

PHF20-212, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene PHF20, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-212ENST00000485604 SERPINB8P50452 374 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 SMSP52788 366 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 CASP6P55212 293 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 SLC37A1P57057 533 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 KRTAP10-9P60411 292 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 ID2Q02363 134 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 FOLH1Q04609 750 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 TGM3Q08188 693 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 CUL3Q13618 768 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 SERTAD2Q14140 314 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 RCN2Q14257 317 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 EBPQ15125 230 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 GGTA1PQ4G0N0 100 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 C4orf46Q504U0 113 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 PIGGQ5H8A4 983 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 C18orf63Q68DL7 685 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 RTL6Q6ICC9 239 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 OR4C11Q6IEV9 310 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 MED27Q6P2C8 311 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 SYT10Q6XYQ8 523 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 C3P1Q6ZMU1 363 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 RTL4Q6ZR62 310 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 RGS9BPQ6ZS82 235 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 CTAGE3PQ8IX95 158 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 FBXW8Q8N3Y1 598 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 FAM109AQ8N4B1 249 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 TMEM251Q8N6I4 163 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 OR52N2Q8NGI0 321 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 PAQR8Q8TEZ7 354 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 CCT6BQ92526 530 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 EXT2Q93063 718 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 ZDHHC16Q969W1 377 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 TMEM125Q96AQ2 219 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 NXNL1Q96CM4 212 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 CMTM7Q96FZ5 175 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 SGCZQ96LD1 299 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 DMRTB1Q96MA1 342 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 CITED4Q96RK1 184 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 FAM173AQ9BQD7 235 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 CCDC77Q9BR77 488 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 OR8D2Q9GZM6 311 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 WWTR1Q9GZV5 400 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 RAB17Q9H0T7 212 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 OR51B5Q9H339 312 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 IL1RL2Q9HB29 575 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 HPF1Q9NWY4 346 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 PSD3Q9NYI0 1048 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 NINJ2Q9NZG7 142 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 TXNDC16Q9P2K2 825 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 SPRR3Q9UBC9 169 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 OPTCQ9UBM4 332 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 PCTPQ9UKL6 214 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 FBXW2Q9UKT8 454 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 ACOT9Q9Y305 439 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 HCFC1P51610 2035 aa4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 A0A096LPK6 155 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 A0A1W2PR48 441 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 OR14I1A6ND48 311 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 OR6C76A6NM76 312 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 WASHC1A8K0Z3 465 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 FAM166BA8MTA8 275 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 G3V3Y1 287 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 ACOT7O00154 380 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 WWP2O00308 870 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 SAP18O00422 153 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 AQP7O14520 342 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 STX16O14662 325 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 PRRG2O14669 202 aa3.99□□□□□ -1.77
PHF20-212ENST00000485604 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms