RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 IFNA7P01567 189 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SOD2P04179 222 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 IFNA16P05015 189 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PROS1P07225 676 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PRPS2P11908 318 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CLCN4P51793 760 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 KCNJ10P78508 379 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 RHAGQ02094 409 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 IRF8Q02556 426 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CPTPQ5TA50 214 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 IL20RBQ6UXL0 311 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HMGN2P46Q86SG4 172 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SERPINA11Q86U17 422 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ASB12Q8WXK4 309 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 EPYCQ99645 322 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 MND1Q9BWT6 205 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PLXNA3P51805 1871 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 GZMMP51124 257 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 LHFPL3Q86UP9 236 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 GDF15Q99988 308 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HCN2Q9UL51 889 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 RFXAPO00287 272 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 XPAP23025 273 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ACRV1P26436 265 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SERPINA4P29622 427 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CRYBB2P43320 205 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 MAP2K6P52564 334 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 EPHA5P54756 1037 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 RPS25P62851 125 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 BICRALQ6AI39 1079 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 VRK3Q8IV63 474 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CHST14Q8NCH0 376 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 FAM46DQ8NEK8 389 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 REPS1Q96D71 796 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ZFP3Q96NJ6 502 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 FZD6O60353 706 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 IGSF6O95976 241 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HBQ1P09105 142 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 DNASE1P24855 282 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 STOMP27105 288 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 TALDO1P37837 337 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SPAM1P38567 509 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 GRM7Q14831 915 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 AANATQ16613 207 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf62Q8N4C0 152 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 DCAF4L2Q8NA75 395 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 TTC9Q92623 222 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 RNFT2Q96EX2 444 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 MED8Q96G25 268 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 C7orf34Q96L11 122 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 GABARAPL3Q9BY60 117 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 EXTL2Q9UBQ6 330 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CCL27Q9Y4X3 112 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 KLK8O60259 260 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ABLIM3O94929 683 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 KDM4BO94953 1096 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 KELP23276 732 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CHIT1Q13231 466 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL22Q53GT1 634 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 LRIF1Q5T3J3 769 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 LIPIQ6XZB0 460 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A46Q96AG3 418 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 C12orf66Q96MD2 445 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 MYO9BQ13459 2157 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 THSD7BQ9C0I4 1608 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SAP18O00422 153 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 LRG1P02750 347 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 EBLN1P0CF75 366 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 AP1S1P61966 158 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 TNK1Q13470 666 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CERS6Q6ZMG9 384 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL1Q9NR64 748 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 OR51B4Q9Y5P0 310 aa15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms