RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 NUDT17P0C025 328 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CALML3P27482 149 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 HNMTP50135 292 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 VAMP7P51809 220 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PGGT1BP53609 377 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 Q0VFX4 171 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GTF2H2Q13888 395 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 KIR2DS5Q14953 304 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 ACKR1Q16570 336 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 RBBP7Q16576 425 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 KLHL10Q6JEL2 608 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SATL1Q86VE3 508 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 STHQ8IWL8 128 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GGHQ92820 318 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 C14orf79Q96F83 325 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 LINGO1Q96FE5 620 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SGK494Q96LW2 274 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CASD1Q96PB1 797 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TSSK2Q96PF2 358 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 NTMT1Q9BV86 223 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB17Q9H0T7 212 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 UBQLN3Q9H347 655 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNJ14Q9UNX9 436 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC168Q8NDH2 2452 aa5.11□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1W2PRB8 838 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF587BE7ETH6 402 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 F8WDY8 70 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC28A1O00337 649 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PDZD2O15018 2839 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 AK1P00568 194 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TPBGLP0DKB5 382 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 HLA-DOBP13765 273 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CPA3P15088 417 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GOT1P17174 413 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 IFNAR2P48551 515 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PITPNBP48739 271 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TAF10Q12962 218 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 LCP2Q13094 533 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 MYBPHQ13203 477 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GIT2Q14161 759 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 IRGCQ6NXR0 463 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR141Q7Z602 305 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC63Q8NA47 563 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 DENND6BQ8NEG7 585 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4A16Q8NH70 328 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SDR42E1Q8WUS8 393 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM3CQ92520 227 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 RFT1Q96AA3 541 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 MED8Q96G25 268 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 IWS1Q96ST2 819 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TXN2Q99757 166 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 ECT2Q9H8V3 914 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 NYAP2Q9P242 653 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SIX4Q9UIU6 781 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SH3GLB1Q9Y371 365 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.1□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 AKAP9Q99996 3911 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A0U1RRA0 63 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 OR6C75A6NL08 312 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 NPIPA3F8WFD2 350 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 ARPC2O15144 300 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 TEX28O15482 410 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 EXTL3O43909 919 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 STBD1O95210 358 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SYF2O95926 243 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 LGALS2P05162 132 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CHRNGP07510 517 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 F3P13726 295 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 CD59P13987 128 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 B4GALT1P15291 398 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PRDX6P30041 224 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PRPHP41219 470 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC6A12P48065 614 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 PDX1P52945 283 aa5.09□□□□□ -1.59
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS6P62753 249 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms