RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 MAPKAPK3Q16644 382 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SPDYAQ5MJ70 313 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CEP85LQ5SZL2 805 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 GALNT18Q6P9A2 607 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF227Q86WZ6 799 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 MMP21Q8N119 569 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 DOK4Q8TEW6 326 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 NR4A3Q92570 626 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CES1P1Q9UKY3 287 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 PSME2Q9UL46 239 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ERVK-19Q9WJR5 959 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ZGRF1Q86YA3 2104 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 POLEQ07864 2286 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 LRRK2Q5S007 2527 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 GOLGA6L10A6NI86 522 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 AZIN1O14977 448 aa18.46■□□□□ 0.55
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CTPS1-206ENST00000470271 NME2P22392 152 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ALDH9A1P49189 494 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 PMP22Q01453 160 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CLEC6AQ6EIG7 209 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CROCCP2Q86T23 111 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 FAM26EQ8N5C1 309 aa18.46■□□□□ 0.55
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CTPS1-206ENST00000470271 PRR7Q8TB68 274 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ASB15Q8WXK1 588 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 RASL10BQ96S79 203 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CENPHQ9H3R5 247 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CXorf21Q9HAI6 301 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SIRT5Q9NXA8 310 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa18.46■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 CLEC18AA5D8T8 446 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 A8MVJ9 347 aa18.45■□□□□ 0.54
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CTPS1-206ENST00000470271 ERLIN1O75477 346 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
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CTPS1-206ENST00000470271 ZNF750Q32MQ0 723 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 FHL5Q5TD97 284 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 CLEC18BQ6UXF7 455 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 RNF111Q6ZNA4 994 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 EXOC3L1Q86VI1 746 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 GALNT12Q8IXK2 581 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 C9orf40Q8IXQ3 194 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 CLEC18CQ8NCF0 446 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 KLHL29Q96CT2 875 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 EBPLQ9BY08 206 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
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CTPS1-206ENST00000470271 ERVK-11Q9UQG0 969 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 CROCCQ5TZA2 2017 aa18.45■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 ASPDHA6ND91 283 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 OR6B1O95007 311 aa18.44■□□□□ 0.54
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CTPS1-206ENST00000470271 BPGMP07738 259 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 IL3P08700 152 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 DRD2P14416 443 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 NT5EP21589 574 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 FEN1P39748 380 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 SOX3P41225 446 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 ETV4P43268 484 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 GSTM5P46439 218 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 TDGF1P3P51864 188 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 SLC37A1P57057 533 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 HEPACAMQ14CZ8 416 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 MPEG1Q2M385 716 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 C6orf163Q5TEZ5 329 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 IL20RBQ6UXL0 311 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 LRIG3Q6UXM1 1119 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 SLC29A4Q7RTT9 530 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 HOMEZQ8IX15 550 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 C16orf78Q8WTQ4 265 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 HEY2Q9UBP5 337 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 UTS2RQ9UKP6 389 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 OR6C76A6NM76 312 aa18.43■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 SLC28A1O00337 649 aa18.43■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 CHEK2O96017 543 aa18.43■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 FGF4P08620 206 aa18.43■□□□□ 0.54
CTPS1-206ENST00000470271 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
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