RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ACTR3	P61158	418 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OLR1	P78380	273 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SHC2	P98077	582 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	FOLH1	Q04609	750 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	LIPE	Q05469	1076 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MAP4K2	Q12851	820 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	FOXC1	Q12948	553 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RIPK1	Q13546	671 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RGN	Q15493	299 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RABL3	Q5HYI8	236 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SAXO2	Q658L1	398 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	HPS6	Q86YV9	775 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ASB9	Q96DX5	294 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ELP4	Q96EB1	424 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TAAR9	Q96RI9	348 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ALG2	Q9H553	416 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	C5AR2	Q9P296	337 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MEN1	O00255	615 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	FGF17	O60258	216 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GSN	P06396	782 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CD63	P08962	238 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CCL4	P13236	92 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	XCR1	P46094	333 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OR1D4	P47884	311 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GSK3B	P49841	420 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MAPK10	P53779	464 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MS4A2	Q01362	244 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RBBP4	Q09028	425 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MGAT2	Q10469	447 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	VEZF1	Q14119	521 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GTDC1	Q4AE62	458 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2L13	Q8N349	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	COL26A1	Q96A83	441 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PEX11G	Q96HA9	241 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF639	Q9UID6	485 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	EMC8	O43402	210 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MGRN1	O60291	552 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	CS	O75390	466 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFRSF21	O75509	655 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	CIB2	O75838	187 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TIAF1	O95411	115 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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