RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458301.5

AFG3L1P-216, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,298 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-216	ENST00000458301	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	UPK1A	O00322	258 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	HMGN4	O00479	90 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	SOCS2	O14508	198 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	JRK	O75564	520 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	KRT75	O95678	551 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	OR12D1	P0DN82	309 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	TNFRSF1B	P20333	461 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	PCGF2	P35227	344 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	SCARB2	Q14108	478 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	VEZF1	Q14119	521 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	NR0B2	Q15466	257 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	NRF1	Q16656	503 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	NATD1	Q8N6N6	113 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	OR7G2	Q8NG99	324 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	OR1L3	Q8NH93	324 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ELP4	Q96EB1	424 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	PEX11G	Q96HA9	241 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	PYURF	Q96I23	114 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		10.5	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	C7orf72	A4D263	438 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ACOX3	O15254	700 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	DIRAS1	O95057	198 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	RAP2A	P10114	183 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ARAF	P10398	606 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	BMP2	P12643	396 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	FAS	P25445	335 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	MPI	P34949	423 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	CNR2	P34972	360 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	CCT8	P50990	548 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	DSTN	P60981	165 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	GPLD1	P80108	840 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	HSD11B2	P80365	405 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	CDK6	Q00534	326 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	CHRNB3	Q05901	458 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	FADD	Q13158	208 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	SYPL1	Q16563	259 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	EME1	Q96AY2	570 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	TAMM41	Q96BW9	452 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	CD180	Q99467	661 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	OR51I1	Q9H343	314 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	EQTN	Q9NQ60	294 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301		M0QX08	132 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	CPM	P14384	443 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	MATN1	P21941	496 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	OR1D4	P47884	311 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	BTG2	P78543	158 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	VAC14	Q08AM6	782 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	CBLL1	Q75N03	491 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	D2HGDH	Q8N465	521 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	ANKFN1	Q8N957	763 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	TPD52L3	Q96J77	140 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		10.49	□□□□□ -0.73
AFG3L1P-216	ENST00000458301	OLAH	Q9NV23	265 aa		10.49	□□□□□ -0.73

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