RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 AIREO43918 545 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 S100A5P33763 92 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 NFATC3Q12968 1075 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 TEAD4Q15561 434 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR19Q15760 415 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SNAPC1Q16533 368 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC157Q569K6 752 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ATAD3BQ5T9A4 648 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 PDZD3Q86UT5 571 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM46DQ8NEK8 389 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ZFP90Q8TF47 636 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 QRFPRQ96P65 431 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM168Q9H0V1 697 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CORO2BQ9UQ03 480 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CARNS1A5YM72 827 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CPN2P22792 545 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL35P42766 123 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL12Q53G59 568 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC15A4Q8N697 577 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 C10orf53Q8N6V4 93 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 IL21RQ9HBE5 538 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 FGF22Q9HCT0 170 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 EHD3Q9NZN3 535 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CDH7Q9ULB5 785 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 OR6C74A6NCV1 312 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2W5A6NFC9 320 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 H0YIV9 168 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 UPK1AO00322 258 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 TMPRSS11DO60235 418 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ACSL1P33121 698 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 UGT2B15P54855 530 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP2CBP62714 309 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP2CAP67775 309 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ST3GAL4Q11206 333 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 TIGD6Q17RP2 521 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC9B2Q86UD5 537 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 OXR1Q8N573 874 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 COQ10AQ96MF6 247 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CNPPD1Q9BV87 410 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 EYSQ5T1H1 3165 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 KNTC1P50748 2209 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR37L1O60883 481 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 NTN1O95631 604 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SCRN3Q0VDG4 424 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNC3Q14003 757 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CLCA4Q14CN2 919 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 REEP3Q6NUK4 255 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CAMKK1Q8N5S9 505 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF607Q96SK3 696 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SACM1LQ9NTJ5 587 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM184CQ9NVA4 438 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 H0YAE9 185 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 PRMT3O60678 531 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SERPINB7O75635 380 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 FURINP09958 794 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ITGA2P17301 1181 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 OPRD1P41143 372 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 PRSS36Q5K4E3 855 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF730Q6ZMV8 503 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SVOPQ8N4V2 548 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD53Q8N9V6 530 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 OR9A2Q8NGT5 310 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CHTF18Q8WVB6 975 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 PSME2Q9UL46 239 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 A8MUA0 341 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 EFCAB9A8MZ26 197 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 H3BSH0 61 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 IFNA16P05015 189 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CCNYL3P0C7X3 344 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CNR2P34972 360 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 MC3RP41968 323 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 PGDP52209 483 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CTBSQ01459 385 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM92BQ6ZTR7 304 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 OOSP2Q86WS3 158 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCB9Q9NP78 766 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 CLN6Q9NWW5 311 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 SOHLH2Q9NX45 425 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 TAAR2Q9P1P5 351 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-210ENST00000437078 MALT1Q9UDY8 824 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms