RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	AIFM1	O95831	613 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CNR1	P21554	472 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	GALNS	P34059	522 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ASPH	Q12797	758 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	FRG2	Q64ET8	278 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	LYPD8	Q6UX82	237 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	POM121	Q96HA1	1249 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	FRG2B	Q96QU4	278 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GTL3	188 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	DYRK3	O43781	588 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM24	O75264	130 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CLPS	P04118	112 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ABHD2	P08910	425 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL3	P10147	92 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	NR2F6	P10588	404 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	GCA	P28676	217 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXO1	Q12778	655 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	GK5	Q6ZS86	529 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CD163	Q86VB7	1156 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC15A4	Q8N697	577 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	UCN3	Q969E3	161 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	16.37	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	GLOD5	A6NK44	160 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ACOT7	O00154	380 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	PGRMC2	O15173	223 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	DIAPH2	O60879	1101 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	GBA	P04062	536 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	TPO	P07202	933 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC35E2	P0CK97	266 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC37A1	P57057	533 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	HERVK_113	P63132	956 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVK-8	P63133	956 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR41	Q9HAD4	459 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	NIN	Q8N4C6	2090 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PS29	197 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MT66	165 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM166B	A8MTA8	275 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738		G3V3Y1	287 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP6C	O00743	305 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	PDE9A	O76083	593 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHG3	P01860	377 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	IGFBP2	P18065	325 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	PLGLB1	Q02325	96 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	IFT88	Q13099	833 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	EMC4	Q5J8M3	183 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	PAOX	Q6QHF9	649 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	METTL4	Q8N3J2	472 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	DOK4	Q8TEW6	326 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MRPL28-203	ENST00000429738	RIT1	Q92963	219 aa		16.35	■□□□□ 0.21

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