RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 PRSS53Q2L4Q9 553 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
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HDLBP-211ENST00000425989 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
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HDLBP-211ENST00000425989 OR51Q1Q8NH59 317 aa9.04□□□□□ -0.96
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HDLBP-211ENST00000425989 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 TGIF2Q9GZN2 237 aa9.04□□□□□ -0.96
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HDLBP-211ENST00000425989 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.04□□□□□ -0.96
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HDLBP-211ENST00000425989 ADPRHL2Q9NX46 363 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CALML5Q9NZT1 146 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ANAPC2Q9UJX6 822 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SNX8Q9Y5X2 465 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
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HDLBP-211ENST00000425989 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.03□□□□□ -0.96
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HDLBP-211ENST00000425989 B4E171 279 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 HCRTR1O43613 425 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 PEX1O43933 1283 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINB7O75635 380 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 BAG2O95816 211 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 STATHP02808 62 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 GUSBP08236 651 aa9.03□□□□□ -0.96
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HDLBP-211ENST00000425989 CD59P13987 128 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FASP25445 335 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CCKBRP32239 447 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 FEN1P39748 380 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 TSPAN7P41732 249 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 MVDP53602 400 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 DSTNP60981 165 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 CDK6Q00534 326 aa9.03□□□□□ -0.96
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HDLBP-211ENST00000425989 HSPB3Q12988 150 aa9.03□□□□□ -0.96
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HDLBP-211ENST00000425989 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
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HDLBP-211ENST00000425989 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.03□□□□□ -0.96
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HDLBP-211ENST00000425989 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-211ENST00000425989 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
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