RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJB5O75953 348 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CLUP10909 449 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ITGB7P26010 798 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PUDPQ08623 228 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXO27Q8NI29 283 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 MAL2Q969L2 176 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CA14Q9ULX7 337 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 FLRT2O43155 660 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAM12O43184 909 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ITIH1P19827 911 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HHEXQ03014 270 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PAGE3Q5JUK9 113 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 FIGNL1Q6PIW4 674 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ATF6P18850 670 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 GRIN2CQ14957 1233 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCA11PQ4W5N1 156 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PLCL2Q9UPR0 1127 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GVI7 797 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 C5orf51A6NDU8 294 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PLOD2O00469 737 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 TP53I11O14683 189 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 THEGLP0DJG4 465 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 USP53Q70EK8 1073 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 DPPA4Q7L190 304 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 THRSPQ92748 146 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 MMP27Q9H306 513 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 RDH14Q9HBH5 336 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 RGRP47804 291 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HLCSP50747 726 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR143P51810 404 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC7A9P82251 487 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 LIPKQ5VXJ0 399 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HS6ST2Q96MM7 605 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 WACQ9BTA9 647 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 DEFB126Q9BYW3 111 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 GDE1Q9NZC3 331 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 EMCNQ9ULC0 261 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SCML1Q9UN30 329 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 MS4A2Q01362 244 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 INPP5KQ9BT40 448 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 DENRO43583 198 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAMTS4O75173 837 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ITGA5P08648 1049 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SHC2P98077 582 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 GPAT4Q86UL3 456 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 MEMO1Q9Y316 297 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HCKP08631 526 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.861e-6■□□□□ 10
PTPRJ-201ENST00000418331 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM225Q6GV28 225 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HYKKA2RU49 373 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 RLN2P04090 185 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 RABIFP47224 123 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ZXDBP98169 803 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SEC23BQ15437 767 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC14A2Q15849 920 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 TTLL10Q6ZVT0 673 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF878C9JN71 531 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 DLGAP1O14490 977 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 T-ENOLP0DO92 83 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 BRF2Q9HAW0 419 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 C5AR2Q9P296 337 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR37L1O60883 481 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 BMP2P12643 396 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 DCKP27707 260 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 LHFPL3Q86UP9 236 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms