RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DRD2P14416 443 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PORP16435 677 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BGNP21810 368 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MLLT10P55197 1068 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MLF1P58340 268 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOXRED1Q6NXP6 359 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GALNT12Q8IXK2 581 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIRREL3Q8IZU9 778 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARMC10Q8N2F6 343 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CATSPER1Q8NEC5 780 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2T11Q8NH01 316 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR8K3Q8NH51 312 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC26Q8NHZ8 85 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MGARPQ8TDB4 240 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCT7Q99832 543 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM4Q9C037 500 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VIPAS39Q9H9C1 493 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PFDN4Q9NQP4 134 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UTS2RQ9UKP6 389 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CES1P1Q9UKY3 287 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A1W2PS29 197 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPMP14384 443 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC1A6P48664 564 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERVK-8P63133 956 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STX3Q13277 289 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TUBA3CQ13748 450 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HORMAD2Q8N7B1 307 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF321PQ8N8H1 164 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR5L2Q8NGL0 311 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPT1CQ8TCG5 803 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF721Q8TF20 911 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYNNQ9NPC7 610 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GIMAP4Q9NUV9 329 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD10Q9NXR5 420 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EHD3Q9NZN3 535 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP10Q9P2G4 905 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HEY2Q9UBP5 337 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERVK-19Q9WJR5 959 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMED5Q9Y3A6 229 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL12A1Q99715 3063 aa16.15■□□□□ 0.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LSM1O15116 133 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITM2AO43736 263 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGKV3-11P04433 115 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP1B1P05026 303 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NT5EP21589 574 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR4P57081 412 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF4P78317 190 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA0040Q15053 153 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR1C1Q15619 314 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GALNTL6Q49A17 601 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CES4AQ5XG92 561 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 Q6ZSR9 355 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IKBIPQ70UQ0 350 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF781Q8N8C0 355 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARL8AQ96BM9 186 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CXorf21Q9HAI6 301 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MIEF1Q9NQG6 463 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYOTQ9UBF9 498 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ENTPD4Q9Y227 616 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAP2CQ9Y3L5 183 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FLNCQ14315 2725 aa16.14■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HRKO00198 91 aa16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRAMEF2O60811 474 aa16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITGA10O75578 1167 aa16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDCP20711 480 aa16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD96P40200 585 aa16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYB561P49447 251 aa16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SSR4P51571 173 aa16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C2orf80Q0P641 193 aa16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INAQ16352 499 aa16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF750Q32MQ0 723 aa16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XKR7Q5GH72 579 aa16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF111Q6ZNA4 994 aa16.13■□□□□ 0.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC29A4Q7RTT9 530 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms