RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACOT8O14734 319 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDE5AO76074 875 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LY6G6DO95868 133 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHEP01854 428 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HSD17B1P14061 328 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SDC1P18827 310 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ME2P23368 584 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CXCR2P25025 360 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CASP6P55212 293 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FOXL2P58012 376 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 REEP5Q00765 189 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCNIQ14094 377 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SSPNQ14714 243 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTGR1Q14914 329 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPIN4Q56A73 249 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAGE3Q5JUK9 113 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C17orf64Q86WR6 236 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PHC2Q8IXK0 858 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRT78Q8N1N4 520 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC58Q96CX6 371 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ASB9Q96DX5 294 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRFN5Q96NI6 719 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF559Q9BR84 538 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NDC1Q9BTX1 674 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DPY30Q9C005 99 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DMRT3Q9NQL9 472 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EPHA6Q9UF33 1036 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BCAP29Q9UHQ4 241 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa8.96□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCM1Q15154 2024 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRORSD1PA6NEY8 169 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF212BA8MTL3 300 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDZK1P1A8MUH7 402 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAP3K7O43318 606 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC19A2O60779 497 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ETHE1O95571 254 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDH1P12830 882 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRPS1L1P21108 318 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC6A2P23975 617 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HRH2P25021 359 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SHMT2P34897 504 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCR8P51685 355 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PHEXP78562 749 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ABATP80404 500 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PWP1Q13610 501 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DSG2Q14126 1118 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPR18Q14330 331 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FXNQ16595 210 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MLIPQ5VWP3 458 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ICE2Q659A1 982 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CAMKMTQ7Z624 323 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AVL9Q8NBF6 648 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR52E1Q8NGJ3 308 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2A1Q8NGT9 310 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC13A3Q8WWT9 602 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STMN2Q93045 179 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VPS33AQ96AX1 596 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AGAP4Q96P64 663 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SARGQ9BW04 601 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EPS8L2Q9H6S3 715 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR6C2Q9NZP2 312 aa8.95□□□□□ -0.98
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms