RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 UCNP55089 124 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 PRAMEP78395 509 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 CACNG1Q06432 222 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 NFATC2Q13469 925 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 POU6F1Q14863 301 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.05□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 FAM57BQ71RH2 274 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 NRROSQ86YC3 692 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 TDRPQ86YL5 185 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 NAGSQ8N159 534 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SFRP1Q8N474 314 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 PEX13Q92968 403 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 FUT8Q9BYC5 575 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 POT1Q9NUX5 634 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 BFARQ9NZS9 450 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 KIAA1456Q9P272 454 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SATB2Q9UPW6 733 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.05□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 H7C0S8 307 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 PPP6CO00743 305 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 NDC80O14777 642 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 UGT1A9O60656 530 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 IL1AP01583 271 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SPARCP09486 303 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 UGT1A6P19224 532 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 UGT1A1P22309 533 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 UGT1A4P22310 534 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 UGT1A3P35503 534 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 UGT1A5P35504 534 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 ABCG1P45844 678 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 NPY2RP49146 381 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 OR1D5P58170 312 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 VSNL1P62760 191 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 NR1D2Q14995 579 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.04□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 IL22Q9GZX6 179 aa6.04□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 UCK1Q9HA47 277 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.04□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.04□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 OR2AG2A6NM03 316 aa6.03□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 MTX2O75431 263 aa6.03□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 OR56A5P0C7T3 313 aa6.03□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 CHMP24386 653 aa6.03□□□□□ -1.44
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USP40-202ENST00000409945 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 NSG1P42857 185 aa6.03□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 CLDN6P56747 220 aa6.03□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 DMPKQ09013 629 aa6.03□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 FOXF2Q12947 444 aa6.03□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 ITIH4Q14624 930 aa6.03□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 PPP1R7Q15435 360 aa6.03□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.03□□□□□ -1.44
USP40-202ENST00000409945 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.03□□□□□ -1.44
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