RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406859.7

NRXN1-211, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NRXN1, Length 2,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-211ENST00000406859 SRRDQ9UH36 339 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 KCND3Q9UK17 655 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 A0A0A6YYJ9 748 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 TRBC2A0A5B9 178 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 C7orf66A4D0T2 115 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 CBX4O00257 560 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 ACSL4O60488 711 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 SCO1O75880 301 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 C1QCP02747 245 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 HLA-DPB1P04440 258 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 MPC1LP0DKB6 136 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 PRKACAP17612 351 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 AOAHP28039 575 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 SLC6A4P31645 630 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 SLC6A12P48065 614 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 SOX9P48436 509 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 DGKGP49619 791 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 CTAG1AP78358 180 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 RAB40BQ12829 278 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 COX10Q12887 443 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 RPA4Q13156 261 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 CHIT1Q13231 466 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 NFE2L1Q14494 772 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 TLK2Q86UE8 772 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 HGDQ93099 445 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 NXPE2Q96DL1 559 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 WACQ9BTA9 647 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 BOCQ9BWV1 1114 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 KIF25Q9UIL4 384 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 J3KTA2 159 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 OR10H3O60404 316 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 WDPCPO95876 746 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 POMCP01189 267 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 IL2RAP01589 272 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 ETFAP13804 333 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 DDCP20711 480 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 IDSP22304 550 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 GALP22466 123 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 BDKRB1P46663 353 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 FGFBP1Q14512 234 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 POU4F3Q15319 338 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 FCN2Q15485 313 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 RGMBQ6NW40 437 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 RTL4Q6ZR62 310 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 USP45Q70EL2 814 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 TIGD4Q8IY51 512 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 HASPINQ8TF76 798 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 RFT1Q96AA3 541 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 SCMH1Q96GD3 660 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 SMIM14Q96QK8 99 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 ATF6BQ99941 703 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 GSX2Q9BZM3 304 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-211ENST00000406859 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms