RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SBK3P0C264 359 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 FAM58BPP0C7Q3 252 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CPA3P15088 417 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 IMPDH1P20839 514 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 RFC3P40938 356 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SOX3P41225 446 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CA7P43166 264 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 MEOX1P50221 254 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 HK2P52789 917 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CASP6P55212 293 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 PKNOX1P55347 436 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 RNF4P78317 190 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 C18orf63Q68DL7 685 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 OR52E8Q6IFG1 317 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 MDGA2Q7Z553 956 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 BANPQ8N9N5 519 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 OR4F6Q8NGB9 312 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 OR8K3Q8NH51 312 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ASB15Q8WXK1 588 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 WNT2BQ93097 391 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 L3HYPDHQ96EM0 354 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL20Q96IG2 436 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 RASL10BQ96S79 203 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF382Q96SR6 550 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 WDR41Q9HAD4 459 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 HPF1Q9NWY4 346 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SNX6Q9UNH7 406 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 PLLPQ9Y342 182 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ASB4Q9Y574 426 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 NCKAP5O14513 1909 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GTL3 188 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PPM1 405 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PR48 441 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 GLOD5A6NK44 160 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 HRKO00198 91 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CCL21O00585 134 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ASNA1O43681 348 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 PEX1O43933 1283 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 OR10H2O60403 315 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 DLX3O60479 287 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CRCPO75575 148 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SUPT7LO94864 414 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 GPR75O95800 540 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 KRT6AP02538 564 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 GBAP04062 536 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 PROCP04070 461 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 KRT6BP04259 564 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV3-11P04433 115 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ABOP16442 354 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN8P19075 237 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 COL8A1P27658 744 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 KRT6CP48668 564 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CDH13P55290 713 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 GPR85P60893 370 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CLCQ05315 142 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 BIKQ13323 160 aa7.1□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SGO1Q5FBB7 561 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF678Q5SXM1 525 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 LIPMQ5VYY2 423 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 MTFR2Q6P444 385 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa7.1□□□□□ -1.27
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