RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 RELTQ969Z4 430 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SGCZQ96LD1 299 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 HBEGFQ99075 208 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 OR6C76A6NM76 312 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 G3V2L1 256 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 H3BQF6 201 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 PGRMC2O15173 223 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ASNA1O43681 348 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 PLIN3O60664 434 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ESRRBO95718 433 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 PROCP04070 461 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 GPR85P60893 370 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 VSNL1P62760 191 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ASPHQ12797 758 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.032e-8■■□□□ 13.7
ATG4B-201ENST00000344376 PSME2Q9UL46 239 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 TLDC2A0PJX2 215 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 WASHC1A8K0Z3 465 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 HRKO00198 91 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 CRCPO75575 148 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 KRT4P19013 534 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 CA7P43166 264 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 XKP51811 444 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 SPIN4Q56A73 249 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 PIGGQ5H8A4 983 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 SLC15A4Q8N697 577 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 AGAP11Q8TF27 550 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 SVILO95425 2214 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ACOT7O00154 380 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 CCL21O00585 134 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 P04436 131 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 NUDT17P0C025 328 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 CPMP14384 443 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 CPA3P15088 417 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ABOP16442 354 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 NT5EP21589 574 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 RFC3P40938 356 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 SLC37A1P57057 533 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 DNAJB13P59910 316 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 PLGLB1Q02325 96 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 EMBQ6PCB8 327 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 GK5Q6ZS86 529 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 DOK4Q8TEW6 326 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 CHTF18Q8WVB6 975 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 UCN3Q969E3 161 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ACPTQ9BZG2 426 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 MCM8Q9UJA3 840 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 PCDH7O60245 1069 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ZG16O60844 167 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ALDH9A1P49189 494 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 NAGLUP54802 743 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 TAGAPQ8N103 731 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 KLHL29Q96CT2 875 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 KCNA7Q96RP8 456 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-201ENST00000344376 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms