RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 KMT5CQ86Y97 462 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 SHISA5Q8N114 240 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 D2HGDHQ8N465 521 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 TANKQ92844 425 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 ELP4Q96EB1 424 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 CIB1Q99828 191 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 BDH2Q9BUT1 245 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.55□□□□□ -0.08
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LIMS1-202ENST00000338045 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.55□□□□□ -0.08
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LIMS1-202ENST00000338045 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.55□□□□□ -0.08
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LIMS1-202ENST00000338045 FHP07954 510 aa14.55□□□□□ -0.08
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LIMS1-202ENST00000338045 AVPR2P30518 371 aa14.55□□□□□ -0.08
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LIMS1-202ENST00000338045 GPR19Q15760 415 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 GALNT10Q86SR1 603 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 ICA1LQ8NDH6 482 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 VCXQ9H320 206 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 NTN4Q9HB63 628 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 PLOD2O00469 737 aa14.54□□□□□ -0.08
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LIMS1-202ENST00000338045 ACOX3O15254 700 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 EMC8O43402 210 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 CHST10O43529 356 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF682O95780 498 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 CER1O95813 267 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 TFPTP0C1Z6 253 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 CPMP14384 443 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 PTGER1P34995 402 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 PRR5P85299 388 aa14.54□□□□□ -0.08
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LIMS1-202ENST00000338045 GRM7Q14831 915 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 GUSBP11Q6P575 273 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM107Q6UX40 140 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.54□□□□□ -0.08
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LIMS1-202ENST00000338045 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 SLC29A1Q99808 456 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF639Q9UID6 485 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 RP1P56715 2156 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 FGF17O60258 216 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 PCDHGA12O60330 932 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 GPR75O95800 540 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 AQP1P29972 269 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 MC3RP41968 323 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
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LIMS1-202ENST00000338045 LTB4RQ15722 352 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 MAPK11Q15759 364 aa14.53□□□□□ -0.08
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LIMS1-202ENST00000338045 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 REEP3Q6NUK4 255 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.53□□□□□ -0.08
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LIMS1-202ENST00000338045 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF597Q96LX8 424 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 C8orf4Q9NR00 106 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-202ENST00000338045 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.53□□□□□ -0.08
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