RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC48A1Q6P1K1 146 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCIMPQ6UWF3 145 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 MDGA2Q7Z553 956 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4K14Q8NGD5 310 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5L2Q8NGL0 311 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUBPLQ8TB37 319 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIT1Q92963 219 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM125Q96AQ2 219 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 APIPQ96GX9 242 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM109Q9BVC6 243 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCM8Q9UJA3 840 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CES1P1Q9UKY3 287 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 OSGIN2Q9Y236 505 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ICE1Q9Y2F5 2266 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERTM1A2A2V5 107 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BQF6 201 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 GUCY1B2O75343 617 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPMP14384 443 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF750Q32MQ0 723 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFRALQ6UXV0 394 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASB15Q8WXK1 588 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM111AQ96PZ2 611 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXorf21Q9HAI6 301 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC17A7Q9P2U7 560 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 A8MVJ9 347 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDH7O60245 1069 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPAG7O75391 227 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNC5CO95185 931 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 XKP51811 444 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC37A1P57057 533 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF844Q08AG5 666 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPIN4Q56A73 249 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF111Q6ZNA4 994 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIAH3Q8IW03 269 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALNT12Q8IXK2 581 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSC4DQ8WTU2 575 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 HPF1Q9NWY4 346 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEY2Q9UBP5 337 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC14L3Q9UDX4 400 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-11Q9UQG0 969 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC5A6Q9Y289 635 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 NADKO95544 446 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL3P08700 152 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CT62P0C5K7 136 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CREB1P16220 341 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINB3P29508 390 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSTR4P31391 388 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEOX1P50221 254 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSM2AQ08AH3 577 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASPHQ12797 758 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 EBPQ15125 230 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPEG1Q2M385 716 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNFT1Q5M7Z0 435 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSM2BQ68CK6 577 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALNT18Q6P9A2 607 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL20RBQ6UXL0 311 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULF2Q8IWU5 870 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSD4Q8NDX1 1056 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL29Q96CT2 875 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAL3ST4Q96RP7 486 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAIM2Q9BWQ8 316 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIRT5Q9NXA8 310 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 EML6Q6ZMW3 1958 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6C76A6NM76 312 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEX1O43933 1283 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM13O60858 407 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRCPO75575 148 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 LDLRP01130 860 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 STSP08842 583 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 PORP16435 677 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF24P17028 368 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 NT5EP21589 574 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDH3A1P30838 453 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR85P60893 370 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUSP2Q05923 314 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 FUT7Q11130 342 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT71Q3SY84 523 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGGQ5H8A4 983 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC6AQ6EIG7 209 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYPD8Q6UX82 237 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM46Q7Z4K8 759 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCP10LQ8TDR4 215 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms