RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ASB6Q9NWX5 421 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ASGR2P07307 311 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 HSD17B1P14061 328 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNC1P48547 511 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 LRIF1Q5T3J3 769 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52P1PQ8NH57 321 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SCAMP4Q969E2 229 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SSX5O60225 188 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 FHP07954 510 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 GMPRP36959 345 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SLAMF1Q13291 335 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 GNMTQ14749 295 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 RHBDF1Q96CC6 855 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF226Q9NYT6 803 aa23.13■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PORP16435 677 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ASPGQ86U10 573 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFP41Q8N8Y5 198 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SCGB1C1Q8TD33 95 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 VRTNQ9H8Y1 702 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 LIPT1Q9Y234 373 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 TBPL1P62380 186 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 LY6G5CQ5SRR4 150 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 NINJ1Q92982 152 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PTGES2Q9H7Z7 377 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CSTAP01040 98 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 OXTRP30559 389 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 DPP6P42658 865 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS26P62854 115 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CRHR2Q13324 411 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF805Q5CZA5 627 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 OR13J1Q8NGT2 312 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR20Q8TBZ3 569 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 MSLNLQ96KJ4 702 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PRODH2Q9UF12 536 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 RCAN2Q14206 197 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 C6orf120Q7Z4R8 191 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 GLYATL1Q969I3 302 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2S2Q9NQN1 319 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC4EQ9ULY5 219 aa23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 BMXP51813 675 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP5CP53041 499 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CLDN8P56748 225 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 UPP1Q16831 310 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM214AQ32MH5 1076 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 EOGTQ5NDL2 527 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPNS2Q96L46 248 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4K3Q96R72 315 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 POTEKPQ9BYX7 375 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC22A31A6NKX4 558 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CA12O43570 354 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 HDHD5Q9BXW7 423 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 FANCGO15287 622 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 L3HYPDHQ96EM0 354 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 FOLH1BQ9HBA9 442 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CFIP05156 583 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 GALTP07902 379 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 HOXB2P14652 356 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 GRPRP30550 384 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 FGL1Q08830 312 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 RIN1Q13671 783 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 RXFP3Q9NSD7 469 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 BMP2P12643 396 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 JAG1P78504 1218 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PRSS48Q7RTY5 328 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 BEST3Q8N1M1 668 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SMARCD2Q92925 531 aa23.11■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PPM1BO75688 479 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR143P51810 404 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf226A1L170 272 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 MITFO75030 526 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 GJB5O95377 273 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFV2P19404 249 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 DOC2AQ14183 400 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 C3orf33Q6P1S2 294 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 OR13C3Q8NGS6 347 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SERTAD3Q9UJW9 196 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 INSL6Q9Y581 213 aa23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms