RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB133Q30KQ1 61 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB110Q30KQ9 67 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 ABCA7Q8IZY2 2146 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CSNK1A1LQ8N752 337 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TSPAN14Q8NG11 270 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 TRPC4Q9UBN4 977 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 PHF11Q9UIL8 331 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SH3GLB1Q9Y371 365 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.46■■□□□ 1.03
VSTM4-201ENST00000298454 CDH3P22223 829 aa21.45■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 DAPP51397 102 aa21.45■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 LTB4RQ15722 352 aa21.45■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 SYPL1Q16563 259 aa21.45■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 SATL1Q86VE3 508 aa21.45■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 XAGE5Q8WWM1 108 aa21.45■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 C3orf18Q9UK00 162 aa21.45■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 PSME2Q9UL46 239 aa21.45■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 TESMINQ9Y4I5 508 aa21.45■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 VCANP13611 3396 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 AQP9O43315 295 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 MC3RP41968 323 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 LIN52Q52LA3 116 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 GALNT5Q7Z7M9 940 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 ARMC8Q8IUR7 673 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 OR4N5Q8IXE1 308 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 SLC28A2O43868 658 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 DPM1O60762 260 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 IGFBP5P24593 272 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 CDH15P55291 814 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 EPS8Q12929 822 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 METTL25Q8N6Q8 603 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 ELP4Q96EB1 424 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC3Q9BQI4 270 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 UCKL1Q9NWZ5 548 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 P2RX2Q9UBL9 471 aa21.44■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 RECKO95980 971 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 SLC36A4Q6YBV0 504 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 OLIG3Q7RTU3 272 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 AVL9Q8NBF6 648 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF555Q8NEP9 628 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 OR5T3Q8NGG3 340 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 SFXN5Q8TD22 340 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 KAT2AQ92830 837 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 C16orf58Q96GQ5 468 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 GRIP2Q9C0E4 1043 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A7Q9Y694 548 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 J3KTA2 159 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 MFN2O95140 757 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 FHP07954 510 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 IL1RL1Q01638 556 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 TTC23Q5W5X9 447 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 COL26A1Q96A83 441 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 NRBF2Q96F24 287 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 SLC38A3Q99624 504 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 EPYCQ99645 322 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 CXorf56Q9H5V9 222 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 THSD1Q9NS62 852 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.43■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 NME6O75414 186 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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VSTM4-201ENST00000298454 XKP51811 444 aa21.42■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 MANEAQ5SRI9 462 aa21.42■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 KDM4DQ6B0I6 523 aa21.42■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 BHLHB9Q6PI77 547 aa21.42■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 UBALD2Q8IYN6 164 aa21.42■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K3Q99759 626 aa21.42■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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VSTM4-201ENST00000298454 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa21.42■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 EMC8O43402 210 aa21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 PROS1P07225 676 aa21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 NR2F1P10589 423 aa21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 CD247P20963 164 aa21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 CAPZBP47756 277 aa21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 RXRGP48443 463 aa21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 RAD23AP54725 363 aa21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD21Q4G0X4 260 aa21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL35Q6PF15 583 aa21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 NUP43Q8NFH3 380 aa21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 GPR32P1Q8NGA4 272 aa21.41■■□□□ 1.02
VSTM4-201ENST00000298454 OR4K14Q8NGD5 310 aa21.41■■□□□ 1.02
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