RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF611Q8N823 705 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF721Q8TF20 911 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 LINGO1Q96FE5 620 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXL20Q96IG2 436 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNC2Q96PR1 638 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 UCN2Q96RP3 112 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPKQ9BS16 269 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL31Q9H511 634 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTR8Q9H981 624 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A5Q9Y345 797 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0G2JN53 185 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CYR61O00622 381 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 GUCA1CO95843 209 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CPN2P22792 545 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 RUNX1T1Q06455 604 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 PAGE2BQ5JRK9 111 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1328Q86T90 577 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNEQ86WN2 208 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 DENND6AQ8IWF6 608 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 OR14L1PQ8NHC6 308 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG4AQ8WYN0 398 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TANKQ92844 425 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TP53INP1Q96A56 240 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 RHBDF1Q96CC6 855 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 RILPQ96NA2 401 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 GNRHR2Q96P88 292 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 EGFL8Q99944 293 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 NT5DC2Q9H857 520 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 NGBQ9NPG2 151 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM160Q9NX00 188 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO5Q9UKT4 447 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX8Q9Y5X2 465 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS13CQ709C8 3753 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PNV4 684 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM187AA6NFU0 413 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 HS3ST1O14792 307 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CLGNO14967 610 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 LDB3O75112 727 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CBR3O75828 277 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SOX30O94993 753 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ETHE1O95571 254 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 RHOXF2BP0C7M4 288 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 MLNP12872 115 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 NID1P14543 1247 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 HNF1AP20823 631 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CERS1P27544 350 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 UGT2B10P36537 528 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC1A2P43004 574 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SRYQ05066 204 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM27E3Q08E93 113 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF5AQ12840 1032 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXF2Q12947 444 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 LAPTM5Q13571 262 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX1Q13596 522 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNG2Q16589 344 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms