RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295987.12

SYN1-201, Transcript of synapsin I, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SYN1, Length 3,299 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1-201ENST00000295987 BBS4Q96RK4 519 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 CCRL2O00421 344 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 B4GALT2O60909 372 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 COQ9O75208 318 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 IFNA14P01570 189 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 EPHX1P07099 455 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 GSTM5P46439 218 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 AVPR1BP47901 424 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 CLDN2P57739 230 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 FAM129CQ86XR2 697 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 STARD8Q92502 1023 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 TIFAQ96CG3 184 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 ZG16BQ96DA0 208 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 BRF2Q9HAW0 419 aa14.71□□□□□ -0.05
SYN1-201ENST00000295987 IGLON5A6NGN9 336 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 DNAJB5O75953 348 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 SLC15A1P46059 708 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 GINS1Q14691 196 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 GHDCQ8N2G8 530 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 OR8K5Q8NH50 307 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 OR51I1Q9H343 314 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 PRKYO43930 277 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 TMCC2O75069 709 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 ARHGEF15O94989 841 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 CD79BP40259 229 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 RUNX1T1Q06455 604 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 SPHARQ15513 63 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 BAK1Q16611 211 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 LRR1Q96L50 414 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 KLHL31Q9H511 634 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 FZD3Q9NPG1 666 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 KLHL3Q9UH77 587 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 IRAK3Q9Y616 596 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 UGT2B17O75795 530 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 CYP17A1P05093 508 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 SLC16A1P53985 500 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 ID2Q02363 134 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 KCNC4Q03721 635 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.7□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 CSO75390 466 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 ARAFP10398 606 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 CD72P21854 359 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 DEFA1P59665 94 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 DEFA3P59666 94 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 CAMK1Q14012 370 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 HERVK_113Q902F9 699 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 FCGR1BQ92637 280 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 DTD2Q96FN9 168 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 OPALINQ96PE5 141 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 GDF15Q99988 308 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 RHBGQ9H310 441 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 A0A1W2PPC1 479 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 EFEMP2O95967 443 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 RECKO95980 971 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 TSPAN19P0C672 248 aa14.69□□□□□ -0.06
SYN1-201ENST00000295987 PTPN2P17706 415 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms