RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 SEPHS1P49903 392 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 XKP51811 444 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 DSTNP60981 165 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 RBBP4Q09028 425 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TP53BP2Q13625 1128 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SCARB2Q14108 478 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SPIDRQ14159 915 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP7Q14244 749 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 LPAL2Q16609 132 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM64Q6YI46 380 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB8BQ92930 207 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ELP4Q96EB1 424 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 BATF3Q9NR55 127 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 FITM1A5D6W6 292 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PDLIM1O00151 329 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CLOCKO15516 846 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 FGF17O60258 216 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 LDB3O75112 727 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF682O95780 498 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MC3RP41968 323 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PRIM2P49643 509 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK6Q00534 326 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 FOLH1Q04609 750 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MYBPC3Q14896 1274 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 NRF1Q16656 503 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PERM1Q5SV97 790 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGED4Q96JG8 741 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PSME2Q9UL46 239 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 HYKKA2RU49 373 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 C7orf72A4D263 438 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TXNDC9O14530 226 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TFPTP0C1Z6 253 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEA2P43356 314 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ID2Q02363 134 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 KAT2AQ92830 837 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TAMM41Q96BW9 452 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CHST10O43529 356 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 LDLRP01130 860 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PNLIPP16233 465 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 AVPR2P30518 371 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 HSD11B2P80365 405 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM53BQ14153 422 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ANGPT1Q15389 498 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 IQCCQ4KMZ1 466 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC80Q76M96 950 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CARFQ8N187 725 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR7G2Q8NG99 324 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF639Q9UID6 485 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PQM1 296 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 OPN1SWP03999 348 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 CPMP14384 443 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKAG1P54619 331 aa8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms