RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 ASPHQ12797 758 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 DUSP8Q13202 625 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SERTAD2Q14140 314 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 RASA2Q15283 850 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CCNG2Q16589 344 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SLC15A4Q8N697 577 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TTLQ8NG68 377 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SLC2A12Q8TD20 617 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 FBXL8Q96CD0 374 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CALHM2Q9HA72 323 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 GRHL1Q9NZI5 618 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 FBXO5Q9UKT4 447 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 KCNE2Q9Y6J6 123 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TRIM64A6NGJ6 449 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TRIM64BA6NI03 449 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SDR42E2A6NKP2 422 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 C4orf51C9J302 202 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CYR61O00622 381 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 GSTA1P08263 222 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ABHD2P08910 425 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 GDF1P27539 372 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SLC18A1P54219 525 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 PRAMEF20Q5VT98 475 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 PAQR3Q6TCH7 311 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 NXPE4Q6UWF7 544 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ZNF321PQ8N8H1 164 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ANKS4BQ8N8V4 417 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 NUBPLQ8TB37 319 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 LINGO1Q96FE5 620 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TRIB1Q96RU8 372 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CCL19Q99731 98 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 DOHHQ9BU89 302 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 PRDM14Q9GZV8 571 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SH2D2AQ9NP31 389 aa11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SONP18583 2426 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 NINQ8N4C6 2090 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 A0A0G2JN53 185 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 LRRC3CA6NJW4 275 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TRAPPC6AO75865 159 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 GUCA1CO95843 209 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 IFNA2P01563 188 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 C1QAP02745 245 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 COX7A2P14406 83 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 GSTM2P28161 218 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SERPINB3P29508 390 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CPA2P48052 419 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 IL2P60568 153 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 GUCY1A3Q02108 690 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ACKR1Q16570 336 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TMPRSS11BQ86T26 416 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CCT6BQ92526 530 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 NTNG2Q96CW9 530 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 MS4A6EQ96DS6 147 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 PERPQ96FX8 193 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CHMP6Q96FZ7 201 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SERINC2Q96SA4 455 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 FAM167BQ9BTA0 163 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 AICDAQ9GZX7 198 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 DAPP1Q9UN19 280 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CAMK2AQ9UQM7 478 aa10.99□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa10.98□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa10.98□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 LRIT2A6NDA9 550 aa10.98□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 RIPK2O43353 540 aa10.98□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 DYRK3O43781 588 aa10.98□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 PLA2G16P53816 162 aa10.98□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 MTTPP55157 894 aa10.98□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 LIM2P55344 173 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms