RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.16□□□□□ -0.14
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SYP-201ENST00000263233 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.14□□□□□ -0.15
SYP-201ENST00000263233 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.14□□□□□ -0.15
SYP-201ENST00000263233 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.14□□□□□ -0.15
SYP-201ENST00000263233 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.14□□□□□ -0.15
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