RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 WASHC1A8K0Z3 465 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 ISM1B1AKI9 464 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 FURINP09958 794 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF763Q0D2J5 394 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 SYTL3Q4VX76 610 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 LCN1P1Q5VSP4 162 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 C19orf18Q8NEA5 215 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 C16orf78Q8WTQ4 265 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC38A5Q8WUX1 472 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CASD1Q96PB1 797 aa20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGSF6O95976 241 aa20.14■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa20.14■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 DCST1Q5T197 706 aa20.14■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.14■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 IL20RBQ6UXL0 311 aa20.14■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.824e-7■■■■□ 26.3
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.14■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.14■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 NATD1Q8N6N6 113 aa20.14■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.14■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 GSAPA4D1B5 854 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 CASKO14936 926 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 HRO43593 1189 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 SYPP08247 313 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 DSTNP60981 165 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSPB3Q12988 150 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 C1DQ13901 141 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 PGBD2Q6P3X8 592 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC30A8Q8IWU4 369 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM19Q96HH6 336 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 NARFLQ9H6Q4 476 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 NPIPB8E9PQR5 432 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 CH25HO95992 272 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 GALTP07902 379 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 ITGB7P26010 798 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPINT3P49223 89 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 HMGA2P52926 109 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 Q6ZVU0 165 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 BMPERQ8N8U9 685 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM63Q969Q1 353 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDCP1Q9H5V8 836 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 EGLN3Q9H6Z9 239 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 FZD3Q9NPG1 666 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 IL20RAQ9UHF4 553 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 DSPPQ9NZW4 1301 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 H0YIV9 168 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRRG1O14668 218 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 INPPL1O15357 1258 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 NME6O75414 186 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARAFP10398 606 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX5P17844 614 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 GINS1Q14691 196 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 SYT14P1Q58G82 188 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRB2Q5IJ48 1285 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM109AQ8N4B1 249 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANGPT4Q9Y264 503 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 C5orf58C9J3I9 102 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 AP1S2P56377 157 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 LAPTM4BQ86VI4 370 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM69Q86WT6 500 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 OXR1Q8N573 874 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR8H1Q8NGG4 311 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC9A6Q92581 669 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCTD7Q96MP8 289 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPATA9Q9BWV2 254 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CSNK1G2-201ENST00000255641 VCANP13611 3396 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms