RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.01□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.01□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.01□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ZIC5Q96T25 663 aa6.01□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 MND1Q9BWT6 205 aa6.01□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 EXD2Q9NVH0 621 aa6.01□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 C1orf226A1L170 272 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 RFXANKO14593 260 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC30A4O14863 429 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 BRINP1O60477 761 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 STK16O75716 305 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 C8GP07360 202 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 AMD1P17707 334 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ACRV1P26436 265 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 KIR3DL1P43629 444 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 VEGFCP49767 419 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 MEDAGQ5VYS4 303 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ATCAYQ86WG3 371 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 GHDCQ8N2G8 530 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 LPCAT1Q8NF37 534 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 GPR156Q8NFN8 814 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 FBXO32Q969P5 355 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 FRMD6Q96NE9 622 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 LYSMD1Q96S90 227 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 INPP5KQ9BT40 448 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 TBCDQ9BTW9 1192 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 MED18Q9BUE0 208 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC22A4Q9H015 551 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 MARK1Q9P0L2 795 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 COPZ2Q9P299 210 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SESN1Q9Y6P5 492 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 A0A0U1RQS6 177 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC12A8A0AV02 714 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM229AB2RXF0 380 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 B4DXG7 233 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 H3BM21 787 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 VEGFDO43915 354 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 TNFRSF21O75509 655 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 RNF224P0DH78 156 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 HLA-EP13747 358 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 MYL9P24844 172 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ITGB8P26012 769 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC19A1P41440 591 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 MAPK8P45983 427 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CHAF1BQ13112 559 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 MAB21L1Q13394 359 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 TRAM2Q15035 370 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CDKN3Q16667 212 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PRSS36Q5K4E3 855 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 USP53Q70EK8 1073 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 AHSA2Q719I0 299 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 OXR1Q8N573 874 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC22A18Q96BI1 424 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 RNF121Q9H920 327 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 KLHL1Q9NR64 748 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 LOC730098B7Z3J9 87 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CLIC1O00299 241 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC31A2O15432 143 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 LILRB5O75023 590 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 EOMESO95936 686 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ANXA5P08758 320 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CCNYL3P0C7X3 344 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ITGB7P26010 798 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ALDH4A1P30038 563 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CDKN2CP42773 168 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CAPZA1P52907 286 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PNLIPRP1P54315 467 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 GPR68Q15743 365 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 LHX8Q68G74 356 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 DOK6Q6PKX4 331 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF605Q86T29 641 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SFT2D1Q8WV19 159 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 MYEOVQ96EZ4 313 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM41AQ96HV5 264 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SPACA7Q96KW9 195 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF285Q96NJ3 590 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 FAM83CQ9BQN1 747 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 DOHHQ9BU89 302 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF226Q9NYT6 803 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 KCMF1Q9P0J7 381 aa6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 DSPPQ9NZW4 1301 aa6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms