RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF721Q8TF20 911 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 UCN2Q96RP3 112 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 A0A096LNT2 108 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PNV4 684 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEB16A2A368 324 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 HS3ST1O14792 307 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO45P0C2W1 286 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 EIPR1Q53HC9 387 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FAM13CQ8NE31 585 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 WNT2BQ93097 391 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CSF3RQ99062 836 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 HAUS8Q9BT25 410 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PDE10AQ9Y233 779 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PLCE1Q9P212 2302 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf105B2RV13 164 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 DYNC1I1O14576 645 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 HAUS5O94927 633 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ETHE1O95571 254 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PLAUP00749 431 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 THBS1P07996 1170 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CFPP27918 469 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 NAGLUP54802 743 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 BTN3A2P78410 334 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 REEP5Q00765 189 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 GAB1Q13480 694 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SLC15A4Q8N697 577 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 OR4K3Q96R72 315 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ADAM19Q9H013 955 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CYR61O00622 381 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ADAM11O75078 769 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SERPINA6P08185 405 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CPN1P15169 458 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MTTPP55157 894 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CRYMQ14894 314 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 BEX5Q5H9J7 111 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TRPV3Q8NET8 790 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CALML6Q8TD86 181 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CAVIN3Q969G5 261 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 STARD4Q96DR4 205 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SNF8Q96H20 258 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PBKQ96KB5 322 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ART5Q96L15 291 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 QRFPRQ96P65 431 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 NDNQ99608 321 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.9□□□□□ -0.02
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0G2JN53 185 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 KLF4O43474 513 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 GABRB3P28472 473 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 FNTAP49354 379 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 NTRK2Q16620 822 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TBCELQ5QJ74 424 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-201ENST00000233025 BICRALQ6AI39 1079 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms