RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 CPN2P22792 545 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 MPIP34949 423 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 YAP1P46937 504 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ALDH3B2P48448 385 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 LIM2P55344 173 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 MAZP56270 477 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM107Q6UX40 140 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ABHD13Q7L211 337 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 IQCHQ86VS3 1027 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 SPEM1Q8N4L4 309 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 MOAP1Q96BY2 351 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ING2Q9H160 280 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 P2RX2Q9UBL9 471 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 TRPC4Q9UBN4 977 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 SH3GLB1Q9Y371 365 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 SCN2AQ99250 2005 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 TNFRSF11BO00300 401 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC28A2O43868 658 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 DNAJB5O75953 348 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 FHP07954 510 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ALOX12P18054 663 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 MAGEA8P43361 318 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 XCR1P46094 333 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 KHKP50053 298 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 PRKAG1P54619 331 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ELOCQ15369 112 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 SYPL1Q16563 259 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 CNPY1Q3B7I2 92 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF691Q5VV52 312 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 BHLHB9Q6PI77 547 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 OR56A1Q8NGH5 318 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 OR4C15Q8NGM1 316 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 OR9A2Q8NGT5 310 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM74BQ9NUR3 256 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 POMT2Q9UKY4 750 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 DAPP1Q9UN19 280 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 DNAH14Q0VDD8 3507 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM131Q92545 1883 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 EML5Q05BV3 1969 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM247A6NEH6 219 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 EMC8O43402 210 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 PDE9AO76083 593 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 PAX7P23759 505 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 IL1RL1Q01638 556 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 SPIBQ01892 262 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 GPR32P1Q8NGA4 272 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 LMX1AQ8TE12 382 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ELP4Q96EB1 424 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 CSF3RQ99062 836 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 SEMA6CQ9H3T2 930 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 TBC1D17Q9HA65 648 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 EXD2Q9NVH0 621 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ENPP4Q9Y6X5 453 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 J3KTA2 159 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 BCKDKO14874 412 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 UGT2B11O75310 529 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 MC3RP41968 323 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 OLR1P78380 273 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 IL18R1Q13478 541 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 MANEAQ5SRI9 462 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 GKN2Q86XP6 184 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ARL14Q8N4G2 192 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 MIPOL1Q8TD10 442 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 GIPC3Q8TF64 312 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 PIP5K1AQ99755 562 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 YIPF4Q9BSR8 244 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 KRT84Q9NSB2 600 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC22A7Q9Y694 548 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGGTA-201ENST00000216840 HCRTR1O43613 425 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms