RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	SVOP	Q8N4V2	548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FIG4	Q92562	907 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PGRMC2	O15173	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	B3GALT2	O43825	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SLC2A1	P11166	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RAC2	P15153	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	AGTR2	P50052	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	GAS6	Q14393	721 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RAB35	Q15286	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TEAD2	Q15562	447 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CDH26	Q8IXH8	852 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	GPAM	Q9HCL2	828 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751		U3KQ87	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751		H0Y8G0	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SLC28A2	O43868	658 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MT-ND5	P03915	603 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RAB8A	P61006	207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	DHCR24	Q15392	516 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CASP12	Q6UXS9	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	HID1	Q8IV36	788 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RGCC	Q9H4X1	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	OR10H2	O60403	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SLC16A8	O95907	504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	APOA2	P02652	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	IDUA	P35475	653 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	BNIP2	Q12982	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	EMC1	Q8N766	993 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM234	Q8WY98	164 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	EPYC	Q99645	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	OR2AT4	A6NND4	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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