RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	PAM	P19021	973 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR143	P51810	404 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX16	P57768	344 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	LMO4	P61968	165 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	LRMP	Q12912	555 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZSV7	163 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF575	Q86XF7	245 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM86B	Q8N661	226 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNB2	Q92953	911 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	PEX11G	Q96HA9	241 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	ADGRG7	Q96K78	797 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF599	Q96NL3	588 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1F2P	Q96R84	312 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	NDST4	Q9H3R1	872 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	COG4	Q9H9E3	785 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	MYNN	Q9NPC7	610 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	LANCL2	Q9NS86	450 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	C5orf60	A6NFR6	353 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLGA8R	I6L899	631 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	TXNDC9	O14530	226 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR137B	O60478	399 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	NR3C1	P04150	777 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	TPBGL	P0DKB5	382 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	IL10	P22301	178 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	JAK1	P23458	1154 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	PDHA2	P29803	388 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	PKLR	P30613	574 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	GATA4	P43694	442 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	MASP1	P48740	699 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	IL1RL1	Q01638	556 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	GALNT2	Q10471	571 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	ACAP2	Q15057	778 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	PPA1	Q15181	289 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	STK11	Q15831	433 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	MST1L	Q2TV78	715 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	BCL7A	Q4VC05	210 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF425	Q6IV72	752 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	BNIPL	Q7Z465	357 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	NAT14	Q8WUY8	206 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	FIG4	Q92562	907 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	COQ8B	Q96D53	544 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF122	Q9H9V4	155 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	PROK2	Q9HC23	129 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	CNIH4	Q9P003	139 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	XPR1	Q9UBH6	696 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	FETUB	Q9UGM5	382 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	SGK494	L7N484	410 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	WNT9B	O14905	357 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	MGRN1	O60291	552 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	PRL	P01236	227 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	LYNX1	P0DP58	116 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	IL1RN	P18510	177 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	PTAFR	P25105	342 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	ETV4	P43268	484 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	STAR	P49675	285 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	PPOX	P50336	477 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54

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