RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 GHRHRQ02643 423 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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CLCN3-211ENST00000613795 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MTFR2Q6P444 385 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.6□□□□□ -1.35
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CLCN3-211ENST00000613795 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.6□□□□□ -1.35
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CLCN3-211ENST00000613795 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C5orf34Q96MH7 638 aa6.6□□□□□ -1.35
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CLCN3-211ENST00000613795 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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CLCN3-211ENST00000613795 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 FAM122BQ7Z309 247 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.6□□□□□ -1.35
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CLCN3-211ENST00000613795 FKBP10Q96AY3 582 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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CLCN3-211ENST00000613795 CAPNS2Q96L46 248 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 EPYCQ99645 322 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.6□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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CLCN3-211ENST00000613795 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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CLCN3-211ENST00000613795 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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CLCN3-211ENST00000613795 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.6□□□□□ -1.35
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CLCN3-211ENST00000613795 NME4O00746 187 aa6.59□□□□□ -1.35
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CLCN3-211ENST00000613795 PCDH7O60245 1069 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DIRAS1O95057 198 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GABARAPO95166 117 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SLC34A2O95436 690 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C8AP07357 584 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ALDH3B1P43353 468 aa6.59□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 INHBCP55103 352 aa6.59□□□□□ -1.35
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