RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 SMPDL3BQ92485 455 aa15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF597Q96LX8 424 aa15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 DACH2Q96NX9 599 aa15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 GPRC5BQ9NZH0 403 aa15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 MED12Q93074 2177 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 ANKRD33BA6NCL7 494 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 DYRK3O43781 588 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 FGF17O60258 216 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 PCSK6P29122 969 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 MSH2P43246 934 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 TBCELQ5QJ74 424 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 VASNQ6EMK4 673 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 UBE3DQ7Z6J8 389 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 ACOT4Q8N9L9 421 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 FBXL20Q96IG2 436 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 ART5Q96L15 291 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 DGAT2Q96PD7 388 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 CAMK2AQ9UQM7 478 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 H7C1Q1 480 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 HRKO00198 91 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 BANF1O75531 89 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 LRATO95237 230 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 HPNP05981 417 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 CDK9P50750 372 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 BIKQ13323 160 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 TSNQ15631 228 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 NTRK2Q16620 822 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 CYP1B1Q16678 543 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 NHSL2Q5HYW2 709 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 P3H2Q8IVL5 708 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 BBOF1Q8ND07 529 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 TRIM58Q8NG06 486 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 ISL2Q96A47 359 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 WDR34Q96EX3 536 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 GAL3ST4Q96RP7 486 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 TRIB1Q96RU8 372 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 PIP5K1AQ99755 562 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 UBQLN3Q9H347 655 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 PLAC1Q9HBJ0 212 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 CLGNO14967 610 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 PRAMEF4O60810 478 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 TRAPPC6AO75865 159 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 SCELO95171 688 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 CPN2P22792 545 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 RPL21P46778 160 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 PLIN5Q00G26 463 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 MSS51Q4VC12 460 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 SLC29A4Q7RTT9 530 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 IGDCC3Q8IVU1 814 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 OR4N5Q8IXE1 308 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 VWA5B2Q8N398 1253 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF592Q92610 1267 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 DIO2Q92813 273 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 EFCAB11Q9BUY7 163 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 MS4A8Q9BY19 250 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 CALHM2Q9HA72 323 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 SLC6A5Q9Y345 797 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 SONP18583 2426 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-230ENST00000600058 EXPH5Q8NEV8 1989 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-230ENST00000600058 SH3D21A4FU49 640 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-230ENST00000600058 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-230ENST00000600058 CES2O00748 559 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms