RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 NUBPLQ8TB37 319 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CALML6Q8TD86 181 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SMPDL3BQ92485 455 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ESAMQ96AP7 390 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 DOHHQ9BU89 302 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 DSCAMO60469 2012 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CRLF1O75462 422 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CLEC3AO75596 197 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TRAPPC6AO75865 159 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 WDR47O94967 919 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SLC6A12P48065 614 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 NAGLUP54802 743 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 PPP2R2BQ00005 443 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CRYMQ14894 314 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 MSS51Q4VC12 460 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ARMC3Q5W041 872 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 GPATCH11Q8N954 259 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ATL1Q8WXF7 558 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 UCN3Q969E3 161 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 PIP5K1AQ99755 562 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 BDH2Q9BUT1 245 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1W2PS29 197 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TAPBPO15533 448 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 IL18BPO95998 194 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 HPNP05981 417 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CXCR5P32302 372 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 OPRM1P35372 400 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 NR1H2P55055 460 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 FBXW4P57775 412 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 NTRK2Q16620 822 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 RNF175Q8N4F7 328 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 NTNG2Q96CW9 530 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TRIM54Q9BYV2 358 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CNIH4Q9P003 139 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 GOSR1O95249 250 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 EPORP19235 508 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 STT3AP46977 705 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 HERVK_113P63132 956 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ERVK-8P63133 956 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 FAM27E3Q08E93 113 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SERTAD2Q14140 314 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 DIO2Q92813 273 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF597Q96LX8 424 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 VWA7Q9Y334 891 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 RNF212BA8MTL3 300 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-208ENST00000590509 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms