RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 C2orf54Q08AI8 447 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 RUNX2Q13950 521 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 CCNG2Q16589 344 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 DCST1Q5T197 706 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 NEPROQ6NW34 567 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 MMGT1Q8N4V1 131 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 LINC01560Q8TB33 94 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 NEIL2Q969S2 332 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 VMP1Q96GC9 406 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 PROK2Q9HC23 129 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 HPF1Q9NWY4 346 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 PAK5Q9P286 719 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 ATG4BQ9Y4P1 393 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.29□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 ROS1P08922 2347 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 TRIM64BA6NI03 449 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 ACOT7O00154 380 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 SYT5O00445 386 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 WDR1O75083 606 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 HRH2P25021 359 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 IVDP26440 423 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 GABRB3P28472 473 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 PIGAP37287 484 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 CETN2P41208 172 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 TRPC1P48995 793 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 MAN2A2P49641 1150 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 ASCL1P50553 236 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 CDKN2DP55273 166 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 PWP1Q13610 501 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 TERF2Q15554 542 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 TRADDQ15628 312 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 TTLL9Q3SXZ7 439 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 Q5PR19 223 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 CAMKMTQ7Z624 323 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 OR56A3Q8NH54 315 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 FAM222BQ8WU58 562 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 ASB15Q8WXK1 588 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 QRFPRQ96P65 431 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 FAM173AQ9BQD7 235 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 MYOTQ9UBF9 498 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RD3L-201ENST00000557640 CLCA1A8K7I4 914 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 HRKO00198 91 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 RAD51CO43502 376 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ZBTB14O43829 449 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 HAUS5O94927 633 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TPSB2P20231 275 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CERS1P27544 350 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 PAFAH1B1P43034 410 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 NPY2RP49146 381 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CCR8P51685 355 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ID2Q02363 134 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 KEAP1Q14145 624 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TPSAB1Q15661 275 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa7.27□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 RTL4Q6ZR62 310 aa7.27□□□□□ -1.25
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