RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557119.2

PITX2-209, Transcript of paired like homeodomain 2, human

TSL 2 BASIC

Gene PITX2, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PITX2-209	ENST00000557119	GDF15	Q99988	308 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PITX2-209	ENST00000557119	ABCG4	Q9H172	646 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PITX2-209	ENST00000557119	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PITX2-209	ENST00000557119	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		21.33	■■□□□ 1.01
PITX2-209	ENST00000557119	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		21.33	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	FAAH	O00519	579 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	SLITRK5	O94991	958 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	ITGAD	Q13349	1161 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	SHH	Q15465	462 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	C2orf27A	Q580R0	203 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	C12orf66	Q96MD2	445 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	FUZ	Q9BT04	418 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	MMP27	Q9H306	513 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	FZD3	Q9NPG1	666 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	GUCY1B2	O75343	617 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	OSM	P13725	252 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	CHM	P24386	653 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	AHR	P35869	848 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	SLC15A1	P46059	708 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	PLD3	Q8IV08	490 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	STX19	Q8N4C7	294 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	LINC00471	Q8N535	108 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	SFXN5	Q8TD22	340 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	ZNF675	Q8TD23	568 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	CLN6	Q9NWW5	311 aa		21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	AIRE	O43918	545 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	ST3GAL4	Q11206	333 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	HSPB3	Q12988	150 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	FGL2	Q14314	439 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	OXA1L	Q15070	435 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	USP43	Q70EL4	1123 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	ITPKC	Q96DU7	683 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	DPH7	Q9BTV6	452 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	UCK2	Q9BZX2	261 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		21.31	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	FUCA1	P04066	466 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	DCST1	Q5T197	706 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	YAF2	Q8IY57	180 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	MOAP1	Q96BY2	351 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	NRTN	Q99748	197 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	OR1A2	Q9Y585	309 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	MAN2B1	O00754	1011 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	CEACAM5	P06731	702 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	CA3	P07451	260 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	STS	P08842	583 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	ADORA3	P0DMS8	318 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	ACP5	P13686	325 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	SSR2	P43308	183 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	GNA13	Q14344	377 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		21.3	■■□□□ 1
PITX2-209	ENST00000557119	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		21.3	■■□□□ 1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms