RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557030.5

ATXN3-246, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 807 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-246ENST00000557030 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FKBP1BP68106 108 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TRAF2Q12933 501 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 IL18R1Q13478 541 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 OLIG2Q13516 323 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 NEDD8Q15843 81 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CCL14Q16627 93 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 NDUFA5Q16718 116 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 RFX4Q33E94 735 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CYBRD1Q53TN4 286 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ALG10Q5BKT4 473 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ENTPD8Q5MY95 495 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 BRMS1LQ5PSV4 323 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF678Q5SXM1 525 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PM20D1Q6GTS8 502 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PAQR9Q6ZVX9 377 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CCDC80Q76M96 950 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FUNDC1Q8IVP5 155 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CEP97Q8IW35 865 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SCML4Q8N228 414 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PARP8Q8N3A8 854 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SVOPLQ8N434 492 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 IPMKQ8NFU5 416 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SLC2A12Q8TD20 617 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TWIST2Q8WVJ9 160 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 DNAJB3Q8WWF6 145 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CASP10Q92851 521 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TAMM41Q96BW9 452 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 LRRC58Q96CX6 371 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 BTN2A3PQ96KV6 586 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 NSMCE2Q96MF7 247 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 GLT1D1Q96MS3 346 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 OMDQ99983 421 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 APOL2Q9BQE5 337 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 NEURL2Q9BR09 285 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 MED10Q9BTT4 135 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 MROQ9BYG7 248 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 MFSD1Q9H3U5 465 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 RMI1Q9H9A7 625 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PLEKHA2Q9HB19 425 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FANCEQ9HB96 536 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 IL21RQ9HBE5 538 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 RASSF1Q9NS23 344 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 DDIT4Q9NX09 232 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CMTM6Q9NX76 183 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 RNF186Q9NXI6 227 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 COX16Q9P0S2 106 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 OR12D3Q9UGF7 316 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SUN2Q9UH99 717 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 DAPK2Q9UIK4 370 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PKP3Q9Y446 797 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TRIP11Q15643 1979 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CITO14578 2027 aa4.5□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 A0A0C4DFX4 3053 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 A0A1W2PP18 115 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 A6NCN8 305 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 NEMP2A6NFY4 417 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SYCE1LA8MT33 242 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FAM72CH0Y354 149 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FXYD1O00168 92 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CLDN5O00501 218 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 STX16O14662 325 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PTGESO14684 152 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TPST1O60507 370 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CRCPO75575 148 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CRYABP02511 175 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ITIH1P19827 911 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 OGNP20774 298 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CAPN3P20807 821 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 HOXC13P31276 330 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CCKARP32238 428 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 RXRGP48443 463 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CCR3P51677 355 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms