RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF385B	Q569K4	471 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SNX32	Q86XE0	403 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	COQ8B	Q96D53	544 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TEX37	Q96LM6	180 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	GPR87	Q9BY21	358 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PIEZO1	Q92508	2521 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PCDH17	O14917	1159 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ALOX12B	O75342	701 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	COX4I1	P13073	169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CPM	P14384	443 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PTPN4	P29074	926 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SOAT1	P35610	550 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	DGKQ	P52824	942 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	OR4D2	P58180	307 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	BTG2	P78543	158 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MXRA7	P84157	204 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	RHAG	Q02094	409 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	HSPB3	Q12988	150 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MED25	Q71SY5	747 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	RAB43	Q86YS6	212 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FITM2	Q8N6M3	262 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	UCN3	Q969E3	161 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	NKD1	Q969G9	470 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ITCH	Q96J02	903 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PANX1	Q96RD7	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SPSB2	Q99619	263 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PP18	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	EBAG9	O00559	213 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	RFXANK	O14593	260 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	KRT34	O76011	436 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SLITRK5	O94991	958 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	KCNH1	O95259	989 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	C6orf47	O95873	294 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SLC35E2	P0CK97	266 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CAPN3	P20807	821 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	STT3A	P46977	705 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	MNAT1	P51948	309 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	SZRD1	Q7Z422	152 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD46	Q86W74	232 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	TSLP	Q969D9	159 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	VPS33A	Q96AX1	596 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDB1-223	ENST00000543658	ART5	Q96L15	291 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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